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Tesis y artículos académicos

En esta colección encontrarás los productos de investigación académica de beneficiarios de COLFUTURO y Fulbright, en diversas disciplinas, como arte, biología, administración e ingeniería.

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    • 15 de Julio de 2019
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Exploration of the UK ports industry and its potential adoption of drone-in-a-box technology = Exploración de la industria portuaria en Reino Unido y su potencial adopción de la tecnología drone-in-a-box

Por: Ana Lucía Correa Díaz | Fecha: 2020

The commercial drones’ market has grown significantly in recent years given its different industries’ applications. Ports are evolving and moving towards Industry 4.0, creating an opportunity for technologies to improve their operations, one being drone-in-a-box technology; however, there is scant understanding of the port industry, its potential customers and the technology needs to be addressed. This study explores the UK port industry and its potential use of drone-in-a-box, to give recommendations to Herotech8 about how to grow in this market. A critical review of the literature was carried out and primary data collected from 14 interviewees, i.e. managers working at ports, people related to the drone industry and experts – with knowledge in drone technology and/or ports. Given the lack of awareness of drone-in-a-box technology, some information was gathered regarding conventional drone technology. Also, to contrast and complement the information, several interviews were conducted with Herotech8’s CEO. Results identified potential customers and their understanding of drone technology – applications, benefits, drawbacks and challenges. A value proposition emerged from these findings, but the impact level on each customer will depend on how their needs could be satisfied. Therefore, a general buying decision process was mapped to identify the crucial steps where needs can be recognised and assessed to deliver high value. The results indicated that although customers had not heard about drone-in-abox technology, they are interested; however, there is a fear of acquiring relatively new technologies and some would rather not be the early adopters. Recommendations were made, highlighting the steps to be taken by Herotech8, having identified the need to gain market share in the port sector, including attracting potential customers’ attention, establishing a process to identify their needs and sealing its first deal.
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Effect of temperature and precipitation on abundance of four bird species and their future perspectives regarding climate change, in the Tibabuyes wetland (Bogotá, Colombia) = Efecto de la temperatura y la precipitación en la abundancia de cuatro especies de aves y sus perspectivas futuras relacionadas con el cambio climático, en el humedal Tibabuyes (Bogotá, Colombia)

Por: Samanta Corredor Velandia | Fecha: 2018

Urban wetlands of Bogotá provide important environmental services such as flood containment, regulation of the water cycle, climate regulation. They are also a source of biodiversity and endemism. The climate change reflected in the increase in the average environmental temperature and in alterations in the precipitation patterns has shown to have effects on wildlife. This dissertation takes as a case study the Tibabuyes wetland, the largest one in Bogotá. Using Mann-Kendall non-parametric tests, Spearman correlations and qualitative information, analyses were conducted to determine the possible effect of temperature and precipitation variation on the abundance of four species of birds for ten years (2007-2016). Three of these species are endemic to Colombia. It was found that the annual average temperature and total annual precipitation in the surroundings of the wetland increased in the last 44 years (1972-2016). For the birds, it was found that Rallus semiplumbeus, Fulica americana columbiana and Vanellus chilensis showed an increase in their populations, however this growth was not statistically related to the climatic variables. Cistothorus apolinari did not show any trend. Changes in the climate have generated modifications in the composition of the aquatic and semi-aquatic vegetation and in the flooded areas, which have been exacerbated by anthropogenic stressors. Future projections for Bogotá consider a high increase in the environmental temperature and a low increase in precipitation, it is estimated that this panorama will affect differentially these species, being more vulnerable to environmental changes those endemic with low population in the wetland. The maintenance in the wetland by environmental entities seems to have a positive effect on the bird abundance, therefore, it is essential to ensure this continuous work and prioritizing the habitat zones of these species. Los humedales urbanos de Bogotá proporcionan importantes servicios ambientales como la contención de inundaciones, la regulación del ciclo del agua y la regulación del clima. También son una fuente de biodiversidad y endemismo. Se ha demostrado que el cambio climático reflejado en el aumento de la temperatura media del medio ambiente y en las alteraciones de los patrones de precipitación tiene efectos en la vida silvestre. Esta disertación toma como estudio de caso el humedal de Tibabuyes, el más grande de Bogotá. Utilizando pruebas no paramétricas de Mann-Kendall, correlaciones de Spearman e información cualitativa, se realizaron análisis para determinar el posible efecto de la variación de la temperatura y las precipitaciones en la abundancia de cuatro especies de aves durante diez años (2007-2016). Tres de estas especies son endémicas de Colombia. Se comprobó que la temperatura media anual y la precipitación total anual en los alrededores del humedal aumentaron en los últimos 44 años (1972-2016). En el caso de las aves, se encontró que Rallus semiplumbeus, Fulica americana columbiana y Vanellus chilensis mostraron un aumento en sus poblaciones, sin embargo, este crecimiento no estuvo estadísticamente relacionado con las variables climáticas. Cistothorus apolinari no mostró ninguna tendencia. Los cambios en el clima han generado modificaciones en la composición de la vegetación acuática y semiacuática y en las zonas inundadas, que se han visto exacerbadas por los factores estresantes antropogénicos. Las proyecciones futuras para Bogotá consideran un alto incremento en la temperatura ambiental y un bajo incremento en la precipitación, se estima que este panorama afectará diferencialmente a estas especies, siendo más vulnerables a los cambios ambientales aquellas endémicas con baja población en el humedal. El mantenimiento en el humedal por parte de las entidades ambientales parece tener un efecto positivo en la abundancia de aves, por lo tanto, es fundamental asegurar este trabajo continuo y priorizar las zonas de hábitat de estas especies.
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How messaging shapes attitudes toward sea otters as a species at risk = Cómo los mensajes pueden modificar las actitudes hacia las nutrias de mar que son especies amenazadas

Por: Alejandra; Chan Echeverri Ochoa | Fecha: 2017

Abstract: To address the drivers of biodiversity loss, conservation efforts must attend to public attitudes toward endangered species. Using sea otters as a species at risk, we examined how messaging shapes people’s attitudes toward this species. Participants viewed a message about sea otters that was either positive (sea otters as keystone species), negative (resource conflict with local fishermen), or neutral (biological facts). The impact of the message on people’s attitudes was measured using Kellert’s typology of basic attitudes toward wild-life. We found that the negative message promoted people’s interests in the practical value of sea otters (utilitarian-consumption attitudes), their habitats (utilitarian-habitat attitudes), and control over sea otters (dominionistic attitudes), even though the negative message was perceived as less convincing and believable than positive or neutral messages. The positive message decreased utilitarian-con- sumption attitudes, and the neutral message decreased utilitarian- habitat attitudes. Our findings suggested that messaging can influ- ence public attitudes toward wildlife. Resumen: Para abordar los motores de la pérdida de biodiversidad, los esfuerzos de conservación deben prestar atención a las actitudes del público hacia las especies amenazadas. Utilizando las nutrias marinas como una especie amenazada, examinamos cómo los mensajes modifican las actitudes de las personas hacia esta especie. Los participantes del estudio vieron un mensaje sobre las nutrias marinas que era positivo (las nutrias marinas como especies clave en los ecosistemas), negativo (conflicto entre las nutrias y los pescadores locales) o neutral (datos biológicos). El impacto del mensaje en las actitudes de las personas se midió utilizando la tipología de actitudes básicas de Kellert hacia la vida silvestre. Descubrimos que el mensaje negativo promovió los intereses de las personas en el valor práctico de las nutrias marinas (actitudes de consumo utilitario), sus hábitats (actitudes de hábitat utilitario) y el control sobre las nutrias marinas (actitudes dominionísticas sobre las nutrias). Esto a pesar de que el mensaje negativo se percibió como menos convincente y menos creíble que los mensajes positivos o neutrales. El mensaje positivo disminuyó las actitudes de consumo utilitario, y el mensaje neutral disminuyó las actitudes de hábitat utilitario. Nuestros hallazgos sugieren que los mensajes pueden influir en las actitudes del público hacia la vida silvestre.
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Approaching human-animal relationships from multiple angles: A synthetic perspective = Acercándose a las relaciones humano-animales desde varios ángulos: Una perspectiva sintética

Por: Alejandra; Karp Echeverri Ochoa | Fecha: 2018

Abstract: Non-human animals are ubiquitous in human lives. We dress with their fur and their skin, we eat their meat, and we visit them in zoos and aquaria. Some animals are cherished as part of our families, while others are vilified as pests and invaders. Human-animal relationships are anything but simple. This paper's overarching objective is to present a synthetic perspective on diverse academic subfields encompassed by the broader field of “human-animal studies”. In doing so, we introduce researchers, students, and practitioners to the many kinds of research about human-animal interactions, to help them navigate appropriate methods, approaches and collaborations, and to better understand conservation and wildlife management problems and their possible solutions (e.g., for preventing illegal wildlife trafficking). We identified 27 fields that study the non-material relationships between humans and animals with diverse epistemologies and methods, interdisciplinary collaborations appeared scarce. Interdisciplinary innovation is key to solving many pressing issues in conservation. Unless conservationists engage with academics and practitioners trained in other fields, such as the multitude of fields comprising human-animal studies, we will likely miss effective solutions to the worlds' problems. In this review, we argue that effective interdisciplinary and cross-paradigmatic research collaborations might require that we be explicit about our positionality as researchers. Resumen: Los animales no humanos son omnipresentes en la vida humana. Nos vestimos con su pelaje y su piel, comemos su carne y los visitamos en zoológicos y acuarios. Algunos animales son apreciados como parte de nuestras familias, mientras que otros son tildados de plagas e invasores. Las relaciones entre humanos y animales no son simples. El objetivo general de este artículo es presentar una perspectiva sintética sobre diversos subcampos académicos abarcados por el campo de los “estudios entre humanos y animales”. Al hacerlo, introducimos a los investigadores, estudiantes y profesionales a los muchos tipos de investigación sobre las interacciones entre humanos y animales, les ayudamos a navegar por métodos, enfoques y colaboraciones apropiados, y a comprender mejor los problemas de conservación y manejo de la vida silvestre y sus posibles soluciones (por ejemplo para prevenir el tráfico ilegal de fauna). Identificamos 27 campos que estudian las relaciones inmateriales entre humanos y animales con diversas epistemologías y diversos métodos. Encontramos que las colaboraciones interdisciplinarias son escasas. La innovación interdisciplinaria es clave para resolver muchos problemas urgentes de la conservación. A menos que los biólogos de la conservación se relacionen con académicos y profesionales capacitados en otros campos, como la multitud de campos que comprenden los estudios entre humanos y animales, probablemente perderemos soluciones efectivas a los problemas del mundo. En esta revisión de literatura, argumentamos que las colaboraciones de investigación interdisciplinarias y transparadigmáticas efectivas requieren que seamos explícitos sobre nuestra posicionalidad como investigadores.
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Precipitation and tree cover gradients structure avian alpha diversity in North‐western Costa Rica = Gradientes de precipitación y de cobertura forestal estructural la diversidad alfa de las aves en el noroeste de Costa Rica

Por: Alejandra; Frishkoff Echeverri Ochoa | Fecha: 2019

Abstract: Changes in climate and land use are modifying biodiversity worldwide. Yet it remains unclear how both drivers interact to structure communities and determine patterns in taxonomic, phylogenetic and functional diversity at local scales. We focused on bird diversity and asked: how do precipitation and forest cover gradients interactively structure these elements of avian diversity? We quantified changes in the abundance and composition of bird communities along independent gradients of regional precipitation, local forest cover and landscape forest cover that serve as proxies for climate drying and habitat conversion. We conducted point counts at 150 sites and statistically accounted for imperfect detection to test how environmental variation shaped community-wide diversity metrics. We found that the three dimensions of diversity diverged in their responses to environmental gradients. Specifically, species richness increased linearly with precipitation, reached maximum values with intermediate tree cover at local scales and peaked at high levels of landscape tree cover. While phylogenetic diversity did not vary strongly across any gradient, functional diversity increased monotonically with both local and landscape-level tree cover. Maximum values of functional diversity only occurred in large patches of forest where the tree cover was >75% at both local and landscape scales. Contrary to our expectations, we did not detect significant interactions between precipitation and tree cover gradients on any metric of local bird diversity. Our findings suggest that taxonomic diversity was more sensitive to environmental gradients than functional and phylogenetic diversity. The lack of synergies between precipitation and forest cover gradients on alpha diversity, at least in this system, simplifies the prospects of predicting future biodiversity change at local scales as our results suggest that climate change and land use act independently of one another. Resumen: Los cambios en el clima y en los usos del suelo están modificando la biodiversidad en todo el mundo. Sin embargo, no es claro cómo interactúan ambos cambios para estructurar las comunidades ecológicas y determinar patrones en la diversidad taxonómica, filogenética y funcional a escalas locales. Nos centramos en la diversidad de aves y nos preguntamos: ¿cómo estructuran interactivamente los gradientes de precipitación y cobertura forestal estos elementos de la diversidad de aves? Cuantificamos los cambios en la abundancia y la composición de las comunidades de aves a lo largo de gradientes independientes de precipitación regional, cobertura forestal local y cobertura forestal paisajística que sirven como sustitutos del secado del clima y la conversión del hábitat. Realizamos conteos de aves en 150 sitios y contabilizamos estadísticamente la detección imperfecta de las especies para probar cómo la variación ambiental afectaba a las métricas de diversidad en toda la comunidad. Descubrimos que las tres dimensiones de la diversidad divergían en sus respuestas a los gradientes ambientales. Específicamente, la riqueza de especies aumentó linealmente con la precipitación, alcanzó valores máximos con cobertura forestal intermedia a escalas locales y alcanzó su punto máximo en niveles altos de cobertura forestal paisajística. Si bien la diversidad filogenética no varió fuertemente a través de ningún gradiente, la diversidad funcional aumentó monótonamente con la cobertura forestal local y paisajística. Los valores máximos de diversidad funcional solo ocurrieron en parches de bosque donde la cobertura forestal era> 75% tanto a escala local como paisajística. Contradiciendo nuestras predicciones, no detectamos interacciones significativas entre la precipitación y los gradientes de cobertura forestal en ninguna métrica de diversidad de aves locales. Nuestros hallazgos sugieren que la diversidad taxonómica es más sensible a los gradientes ambientales que la diversidad funcional y filogenética. La falta de sinergias entre la precipitación y los gradientes de la cobertura forestal en la diversidad alfa, al menos en este sistema, simplifica las perspectivas de predecir el cambio futuro de la biodiversidad a escalas locales, ya que nuestros resultados sugieren que el cambio climático y el uso de la tierra actúan de forma independiente.
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Precipitation and tree cover gradients structure avian alpha diversity in North‐western Costa Rica = Gradientes de precipitación y de cobertura forestal estructural la diversidad alfa de las aves en el noroeste de Costa Rica

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Iconic manakins and despicable grackles: Comparing cultural ecosystem services and disservices across stakeholders in Costa Rica = Saltarines icónicos y zanates odiados: Comparando los servicios ecosistémicos culturales entre los actores sociales en Costa Rica

Por: Alejandra; Naidoo Echeverri Ochoa | Fecha: 2019

Despite the great cultural and economic benefits associated with birdwatching and other bird-related cultural ecosystem services (CES), little is known about the bird-related CES and disservices perceived by people, and how they differ across stakeholders and species. The goal of this study was to explore CES and disservices across three stakeholder groups in Northwestern Costa Rica. We conducted surveys (n = 404 total) in which we presented farmers (n = 140), urbanites (n = 149), and birdwatchers (n = 115) with illustrations and songs of bird species and collected participants’ ratings on items designed to measure multiple CES and disservices. We found bird-related CES and disservices were perceived as six different categories: identity, bequest, education, birdwatching, acoustic aesthetic, and disservices. The three stakeholder groups expressed varying preferences across services, disservices, and species. Specifically, birdwatchers ranked species higher in terms of their education scores and lower in disservices scores compared to the other two groups, whereas farmers scored species higher on identity scores com- pared to the other two groups. Farmers and urbanites had remarkably similar perceptions towards birds in general, but differed from birdwatchers. Our approach represents a novel method for assessing CES and disservices associated with species that can be adapted and modified for different taxa and multiple geographical contexts. Resumen: A pesar de los grandes beneficios culturales y económicos asociados con la observación de aves y otros servicios ecosistémicos culturales (SEC) relacionados con las aves, se sabe poco sobre los SEC relacionados con las aves y los perjuicios que perciben las personas sobre ellas. En particular, no se sabe cómo difieren entre los actores sociales y las especies. El objetivo de este estudio fue explorar los SEC y los perjuicios que la gente percibia sobre las aves comparando tres grupos de actores sociales en el noroeste de Costa Rica. Realizamos encuestas (n = 404 en total) en las que presentamos a agricultores (n = 140), residentes locales (n = 149) y observadores de aves (n = 115) ilustraciones y cantos de especies de aves y recopilamos las calificaciones que los participantes le daban a los diferentes items diseñados para medir múltiples SEC y perjuicios. Encontramos que los SEC relacionados con las aves y los perjuicios se percibieron como seis categorías diferentes: identidad, legado, educación, observación de aves, estética acústica y perjuicios. Los tres grupos de actores sociales expresaron diferentes preferencias en cuanto a los SEC y a las especies. Específicamente, los observadores de aves clasificaron a las especies de aves más alto en términos de puntajes de educación y más bajo en puntajes de perjuicio en comparación con los otros dos grupos, mientras que los agricultores calificaron a las especies más alto en puntajes de identidad en comparación con los otros dos grupos. Los agricultores y los habitantes de las ciudades tuvieron percepciones notablemente similares hacia las aves en general, pero difirieron de los observadores de aves. Nuestro enfoque representa un método novedoso para evaluar SEC asociados con las especies que puede ser adaptado y modificado para diferentes grupos taxonómicos y para varios contextos geográficos.
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Can avian functional traits predict cultural ecosystem services? = Será que los rasgos funcionales de las aves pueden predecir los servicios ecosistémicos culturales?

Por: Alejandra; Karp Echeverri Ochoa | Fecha: 2020

The functional trait diversity of species assemblages can predict the provision of ecosystem services such as pollination and carbon sequestration, but it is unclear whether the same trait‐based framework can be applied to identify the factors that underpin cultural ecosystem services and disservices. To explore the relationship between traits and the contribution of species to cultural ecosystem services and disservices, we conducted 404 questionnaire surveys with birdwatchers and local residents in Guanacaste, Costa Rica. We used an information–theoretic approach to identify which of 20 functional traits for 199 Costa Rican bird species best predicted their cultural ecosystem service scores related to birdwatching, acoustic aesthetics, education and local identity, as well as disservices (e.g. harm to crops). We found that diet was the most important variable explaining perceptions of cultural ecosystem service and disservice providers. Aesthetic traits such as plumage colour and pattern were important in explaining birdwatching scores. We also found people have a high affinity for forest‐affiliated birds. The insight that functional traits can explain variation among cultural perspectives on values derived from birds offers a first step towards a trait‐based system for understanding the species attributes that underpin cultural ecosystem services and disservices. Resumen: La diversidad de rasgos funcionales de los ensamblajes de comunidades de especies ayuda a explicar la provisión de servicios ecosistémicos como la polinización y el secuestro de carbono, pero no es claro si esta lógica también se puede aplicar a los servicios ecosistémicos culturales. Para explorar la relación entre los rasgos funcionales y la contribución de las especies a los servicios ecosistémicos culturales, realizamos 404 encuestas con observadores de aves y residentes locales en Guanacaste, Costa Rica. Utilizamos un enfoque teórico de la información para identificar cuáles rasgos funcionales de 199 especies de aves costarricenses predecían mejor sus puntajes en servicios ecosistémicos culturales tales como: la observación de aves, la estética acústica, la educación y la identidad local, y los perjuicios (por ejemplo, daño que las aves le causan a los cultivos). Descubrimos que la dieta era el rasgo más importante para explicar las percepciones de la gente hacia los servicios ecosistémicos culturales generados por las aves. Los rasgos estéticos como el color y el patrón del plumaje fueron importantes para explicar las percepciones de la gente frente a la observación de aves. También encontramos que las personas tienen una alta afinidad por las aves afiliadas al bosque. La idea de que los rasgos funcionales pueden explicar la variación entre los servicios ecosistémicos generados por las aves ofrece un primer paso para comprender los atributos de las especies que generan los servicios ecosistémicos culturales.
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Can avian functional traits predict cultural ecosystem services? = Será que los rasgos funcionales de las aves pueden predecir los servicios ecosistémicos culturales?

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Avian cultural services peak in tropical wet forests = Los servicios culturales avícolas alcanzan su punto máximo en los bosques tropicales húmedos

Por: Alejandra; Karp Echeverri Ochoa | Fecha: 2020

The current biodiversity crisis involves major shifts in biological communities at local and regional scales. The consequences for Earth’s life-support systems are increasingly well-studied, but knowledge of how community shifts affect cultural services associated with wildlife lags behind. We integrated bird census data (3 years across 150 point-count locations) with questionnaire surveys (>400 people) to evaluate changes in culturally important species across climate and land-use gradients in Costa Rica. For farmers, urbanites, and birdwatchers alike, species valued for identity, bequest, birdwatching, acoustic aesthetics, and education were more likely to occupy wetter regions and forested sites, whereas disliked species tended to occupy drier and deforested sites. These results suggest that regional climate drying and habitat conversion in the Neotropics are likely to threaten the most culturally important bird species. This study provides a novel and generalizable pathway for assessing the effects of environmental changes on cultural services and integrating the sociocultural and ecological dimensions of biodiversity. Resumen: La actual crisis de la biodiversidad implica cambios importantes en las comunidades biológicas a escala local y regional. Las consecuencias para los sistemas de soporte vital de la tierra se estudian cada vez más, pero el conocimiento de cómo los cambios en las comunidades de especies afectan los servicios culturales asociados con la vida silvestre no ha sido tan estudiada. Integramos datos de censos de aves (datos de 3 años en 150 puntos de muestreo) con datos de encuestas (> 400 personas) para evaluar los cambios en las especies más importantes culturalmente a través de gradientes climáticos y de uso de la tierra en Costa Rica. Para los agricultores, residentes locales y observadores de aves por igual, las especies valoradas por su identidad, legado, observación de aves, estética acústica y educación ocuparon regiones más húmedas y sitios boscosos, mientras que las especies menos queridas tendían a ocupar sitios más secos y deforestados. Estos resultados sugieren que la sequía del clima y la conversión del hábitat en el Neotrópico probablemente amenacen a las especies de aves que tienen mayor valor cultural. Este estudio proporciona una vía novedosa y generalizable para evaluar los efectos de los cambios ambientales en los servicios culturales provistos por las especies e integrar las dimensiones socioculturales y ecológicas de la biodiversidad.
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A mile in the referee’s shoes: Challenges and opportunities in the implementation of Formative Assessment practices at undergraduate theatre programs. A study of a course from its participants’ perceptions = Una milla en los zapatos del árbitro: Retos y oportunidades en la implementación de prácticas de Evaluación Formativa en programas de teatro de pregrado. Estudio de un curso desde las percepciones de sus participantes

Por: Juan Sebastián Cruz Prieto | Fecha: 2019

Abstract: This research was conducted to analyse undercover narratives of the participants of an undergraduate theatre program in Colombia and their impact on assessment practices. To collect data, semi-structured interviews were held with professors and students, and the analysis contrasted the data with debates between the utilitarian and the humanist approaches to theatre education and pedagogic debates between modernist and postmodernist approaches. The results showed that those debates are present in the participants’ narratives and arise paradoxes to the issue. This research proposes that further curriculum research development must acknowledge them and aim to create an Intersubjective Curriculum. Resumen: Esta investigación fue llevada a cabo con el objetivo de analizar las narrativas ocultas de los participantes de un programa de teatro de pregrado en Colombia y su impacto en las prácticas evaluativas. Para recolectar datos, se llevaron a cabo entrevistas semi-estructuradas con docentes y estudiantes, y en la etapa de análisis se contrastaron los mismos con los debates entre las perspectivas humanitaria y utilitarista de la educación teatral y con los debates pedagógicos entre las perspectivas modernista y postmodernista. Los resultados mostraron que estos debates están presentes en las narrativas de los participantes y hacen surgir paradojas a la cuestión. Esta investigación propone que las posteriores investigaciones sobre desarrollo curricular deben tomar en cuenta estas narrativas y perspectivas y aspirar a construir un Currículo Intersubjetivo.
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Survival analysis of the most frequent Single Nucleotide Variants in Hepatocellular Carcinoma = Análisis de supervivencia de las variantes de un único nucleótido en Carcinoma Hepatocelular

Por: Jimmy Andrés Daza Barragán | Fecha: 2020

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common type of liver cancer and its incidence is rising. The introduction of new systemic therapies, including immune-based therapies and biomarker driven therapies, has improved survival in patients at advanced stages. However, overall survival is still poor, and recent advances in understanding of the molecular alterations of HCC have not translated yet into novel biomarkers. Over the past decade, major advancements in 'omic' technologies have enabled monitoring of a variety of molecular and organismal processes. A comprehensive analysis of single gene mutations in HCC might lead to detect biomarkers that improve our prognosis and treatment. We developed a bioinformatics pipeline capable of analyzing genomic data to identify key regulatory molecular changes in HCC development and their influence in patient’s prognosis. By looking at genetically determined subgroups of HCC in the TCGA Liver Cancer dataset, we managed to obtain 15 genes frequently affected by oncogenic mutations and analyzed their influence in patient’s survival, identifying CSMD1 as a prognostic biomarker candidate. Nevertheless, the validation in the ICGC HCC database showed that it did not have any statistically significant influence in overall survival. This work reveals that the most frequent single gene mutations are not enough for significant survival changes in HCC and that we should focus our efforts in integrative analysis of clinical information and multi-omics to maximize our clinical benefits in this devastating disease. Resumen: El carcinoma hepatocelular (CHC) es el tipo más común de cáncer de hígado y su incidencia está aumentando. La introducción de nuevas terapias sistémicas, incluidas las inmunoterapias y las terapias impulsadas por biomarcadores, ha mejorado la supervivencia de los pacientes en etapas avanzadas. Sin embargo, la supervivencia general sigue siendo escasa y los avances recientes en la comprensión de las alteraciones moleculares del CHC aún no se han traducido en nuevos biomarcadores. Durante la última década, los principales avances en las tecnologías "ómicas" han permitido el seguimiento de una variedad de procesos moleculares y orgánicos. Un análisis completo de las mutaciones de un solo gen en el CHC podría conducir a detectar biomarcadores que mejoren nuestro pronóstico y tratamiento. Desarrollamos un protocolo de bioinformática capaz de analizar datos genómicos para identificar cambios moleculares reguladores clave en el desarrollo del CHC y su influencia en el pronóstico del paciente. Al observar subgrupos genéticamente determinados de CHC en la base de datos TCGA-Liver Cancer, logramos obtener 15 genes frecuentemente afectados por mutaciones oncogénicas y analizamos su influencia en la supervivencia del paciente, identificando CSMD1 como un candidato a biomarcador pronóstico. Sin embargo, la validación en la base de datos ICGC-CHC mostró que no tuvo ninguna influencia estadísticamente significativa en la supervivencia global. Este trabajo revela que las mutaciones de un solo gen más frecuentes no son suficientes para cambios significativos en la supervivencia del CHC y que debemos centrar nuestros esfuerzos en el análisis integrador de la información clínica y la multi-ómica para maximizar nuestros beneficios clínicos en esta devastadora enfermedad.
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Survival analysis of the most frequent Single Nucleotide Variants in Hepatocellular Carcinoma = Análisis de supervivencia de las variantes de un único nucleótido en Carcinoma Hepatocelular

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