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Se encontraron 110737 resultados en recursos

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

En la última década, el volumen de datos "ómicos" generados por las diferentes tecnologías de alto rendimiento ha crecido exponencialmente. La gestión, el almacenamiento y el análisis de estos grandes volúmenes de datos han supuesto un gran reto para los investigadores, especialmente cuando se avanza hacia el objetivo de generar hipótesis comprobables basadas en datos, que ha sido la promesa de las técnicas experimentales de alto rendimiento. Se han desarrollado diferentes enfoques bioinformáticos para agilizar los análisis posteriores proporcionando información independiente para interpretar y realizar inferencias biológicas. La minería de textos (también conocida como minería de literatura) es uno de los enfoques más utilizados para la generación automatizada de conocimiento biológico a partir del enorme número de artículos publicados. En este artículo de revisión, se analizan los avances recientes en los enfoques que integran los resultados de los datos ómicos y la información generada a partir de enfoques de minería de textos para descubrir información biomédica novedosa.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

Los ARN circulares (circRNAs) son una clase de ARN no codificantes (ncRNAs) que forman estructuras de bucle continuo covalentemente cerradas, carentes de los extremos terminales 5? y 3?. Los circRNAs se generan en el proceso de back-splicing y pueden originarse en diferentes regiones genómicas. Su estructura circular única hace que sean más estables que los ARN lineales. Además, también muestran insensibilidad a la actividad ribonucleasa. En general, los circARN funcionan como esponjas de microARN (miARN) y tienen un papel regulador en la transcripción y la traducción. También pueden traducirse in vivo de forma independiente de la cápsula para generar proteínas específicas. En la última década, las técnicas de secuenciación de nueva generación, especialmente RNA-seq, han revelado una gran abundancia y también desregulación de muchos circRNAs en diversas enfermedades, lo que sugiere su implicación en el desarrollo y progresión de enfermedades. Debido a su gran estabilidad y a sus patrones de expresión diferencial relativamente específicos en los tejidos y en el entorno extracelular (por ejemplo, los fluidos corporales), se consideran nuevos biomarcadores prometedores en el cáncer. Por lo tanto, esta revisión se centra en la descripción de la biogénesis, la función y la implicación de los circARN en el desarrollo del cáncer humano y aborda el potencial de los circARN para ser utilizados eficazmente como nuevos biomarcadores de diagnóstico y pronóstico del cáncer.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

La genómica es una disciplina de la genética que estudia la composición del genoma de los organismos y la estructura precisa de los genes, así como su expresión y regulación. La investigación genómica ha resuelto muchos problemas en los que otros métodos biológicos habían fracasado. Aquí resumimos los avances en genómica de plantas acuáticas centrándonos en los marcadores moleculares, los genes relacionados con la fotosíntesis y la tolerancia al estrés, el estudio comparativo de genomas y la tecnología de secuenciación del genoma/transcriptoma.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

Cada vez hay más pruebas de que los microARN (miARN) desempeñan un papel importante en la respuesta inmunitaria contra agentes infecciosos, lo que sugiere que los miARN podrían ser explotables como firmas de exposición a agentes infecciosos específicos. Para identificar posibles biomarcadores de miARN tempranos de infecciones bacterianas, se expusieron células mononucleares de sangre periférica humana (hPBMC) a dos agentes selectos, Burkholderia pseudomallei K96243 y Francisella tularensis SHU S4, así como al control no patógeno Escherichia coli DH5?. Se recogieron muestras de ARN en tres momentos tempranos, 30, 60 y 120 minutos después de la exposición, y se secuenciaron. Los análisis de RNAseq identificaron 87 miRNAs expresados diferencialmente (DE) de forma lineal. De ellos, 31 miARN se analizaron mediante el ensayo miScript miRNA qPCR. Mediante la identificación por RNAseq y la validación por qPCR, identificamos especies de miRNA expresadas diferencialmente que pueden estar implicadas en la respuesta temprana a las infecciones bacterianas. Sobre la base de su regulación al alza en los primeros momentos tras la exposición en dos individuos diferentes, hsa-mir-30c-5p es una especie de miARN que podría estudiarse más a fondo como posible biomarcador de la exposición a estos patógenos intracelulares gramnegativos. Los análisis funcionales de ontología génica demostraron que la muerte celular programada es el proceso biológico de primer orden asociado a los miARN que están regulados al alza en las hPBMC expuestas a F. tularensis.

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

El tratamiento óptimo de los pacientes con cáncer de tiroides requiere el uso de biomarcadores sensibles y específicos. Para un diagnóstico precoz y un seguimiento eficaz, los biomarcadores citológicos y séricos actualmente disponibles, la tiroglobulina y la calcitonina, presentan graves limitaciones. La investigación sobre la expresión de microARN en tumores tiroideos está proporcionando nuevos conocimientos para el desarrollo de nuevos biomarcadores que pueden utilizarse para diagnosticar el cáncer de tiroides y optimizar su tratamiento. En esta revisión, examinaremos algunos de los métodos utilizados habitualmente para detectar y cuantificar microARN en bioespecímenes de pacientes con tumor de tiroides, así como las aplicaciones potenciales de estas técnicas para desarrollar biomarcadores basados en microARN para el diagnóstico y la evaluación pronóstica de los cánceres de tiroides.

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

Los análisis tradicionales de un QTL en la Bota 19 implican un exceso de candidatos, pero cada uno de ellos tiene una importancia marginal para explicar la deposición de grasa saludable de baja temperatura de fusión en el músculo marmóreo del ganado Wagyu. Como enfoque alternativo, hemos utilizado la segregación genómica multigeneracional para identificar 14 haplotipos ancestrales conservados de 20 Mb. Éstos determinan el grado y la tasa de marmoleo del ganado Wagyu y de otras razas. La temperatura de fusión de la grasa intramuscular es altamente heredable y rastreable mediante haplotipos. Afortunadamente, para la producción de carne de vacuno sana, algunos de estos haplotipos son suficientemente penetrantes para expresarse en cruces heterocigotos, lo que permite seleccionar sementales que mejorarán la salubridad de la carne de vacuno producida incluso en condiciones climáticas duras. La región de Bota 19 es sinténica con una región de Hosa 17 conocida por su importancia en el metabolismo muscular y por determinar la susceptibilidad a una forma de distrofia muscular humana.

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

Paulownia fortunei es una especie forestal económica ampliamente cultivada que es susceptible a la infección por fitoplasma, lo que provoca la enfermedad de la escoba de bruja de Paulownia (PaWB). La P. fortunei enferma se caracteriza por un crecimiento atrofiado, escoba de bruja, entrenudos acortados y hojas etioladas y más pequeñas. Para comprender el mecanismo molecular de su patogénesis, aplicamos etiquetas isobáricas para cuantificación relativa y absoluta (iTRAQ) y cromatografía líquida acoplada con espectrometría de masas en tándem para estudiar los cambios en los proteomas de P. fortunei sano, P. fortunei infectado por PaWB y P. fortunei infectado por PaWB tratado con 15 mg-L-1 o 75 mg-L-1 de dimetil sulfato. Identificamos 2969 proteínas y 104 y 32 proteínas diferencialmente abundantes que eran sensibles a la infección por fitoplasma y sensibles al dimetil sulfato, respectivamente. Basándonos en nuestro análisis de los diferentes proteomas, se identificaron 27 proteínas relacionadas con PaWB. Se analizaron las interacciones proteína-proteína de estas 27 proteínas y se clasificaron en cuatro grupos (relacionadas con la fotosíntesis, relacionadas con la energía, relacionadas con el ribosoma y proteínas individuales). Estas proteínas relacionadas con PaWB pueden ayudar a desarrollar una comprensión más profunda de cómo PaWB afecta a las características morfológicas de P. fortunei y establecer aún más los mecanismos implicados en la respuesta de P. fortunei al fitoplasma.

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

El uso de clasificadores basados en la expresión génica ha dado lugar a una serie de prometedoras firmas potenciales de diagnóstico, pronóstico y respuesta terapéutica de los pacientes. Sin embargo, estos enfoques también han creado dificultades al intentar utilizar la expresión génica por sí sola para predecir un rasgo complejo. Un enfoque práctico de este problema consiste en integrar los conocimientos biológicos existentes con la expresión génica para construir un predictor compuesto. Estudiamos el problema de predecir la sensibilidad a la radiación en líneas celulares de cáncer humano a partir de la expresión génica. En primer lugar, presentamos pruebas de la necesidad de integrar condiciones biológicas conocidas (tejido de origen, RAS y estado mutacional de p53) en un problema de predicción de la expresión génica que implique sensibilidad a la radiación. A continuación, demostramos mediante regresión lineal una técnica para incorporar este conocimiento. Las correlaciones resultantes entre la expresión génica y la sensibilidad a la radiación mejoraron mediante el uso de esta técnica (el R2 ajustado del mejor ajuste aumentó de 0,3 a 0,84). Se examinó el sobreajuste de los datos mediante el uso de la simulación. Los resultados refuerzan el concepto de que la sensibilidad a la radiación no depende únicamente de la expresión génica, sino más bien de una combinación de distintos parámetros. Demostramos que tener en cuenta la heterogeneidad biológica mejora significativamente la capacidad del modelo para identificar genes asociados a la radiosensibilidad.

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

Los análisis genómicos están definiendo numerosas dianas nuevas para la terapia del cáncer. Las terapias dirigidas a dianas genéticas y epigenéticas específicas en las células cancerosas, así como el mayor desarrollo de inmunoterapias, están exigiendo cada vez más modelos animales. Los modelos experimentales tradicionales no poseen las características colectivas (heterogeneidad del cáncer, complejidad molecular, invasión, metástasis y respuesta de las células inmunitarias) fundamentales para predecir el éxito o el fracaso de las terapias emergentes en humanos. Sin embargo, cada vez hay más pruebas de que los perros con formas específicas de cáncer natural pueden servir como modelos animales de gran relevancia para complementar los modelos tradicionales. Por ejemplo, el cáncer invasivo de vejiga urinaria (carcinoma urotelial invasivo) en perros se asemeja mucho al cáncer en humanos en cuanto a patología, características moleculares, comportamiento biológico, incluidos los lugares y la frecuencia de metástasis a distancia, y respuesta a la quimioterapia. Los análisis genómicos están definiendo otras similitudes intrigantes entre el InvUC en perros y el de los humanos. Se han completado múltiples ensayos clínicos caninos, y otros están en marcha con el objetivo de trasladar importantes hallazgos a los humanos para aumentar la tasa de éxito de los ensayos en humanos, así como para ayudar a los perros mascota. Se revisarán ejemplos de estudios exitosos de terapias dirigidas y los retos que hay que superar para utilizar plenamente los modelos caninos naturales de cáncer.

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Por: Hindawi | Fecha: 2017

Los microARN (miARN), de unos 22 nucleótidos (nt) de longitud, son una clase de molécula de ARN endógeno y no codificante que desempeña un papel esencial en el desarrollo de las plantas, ya sea suprimiendo la transcripción de genes diana a nivel transcripcional o inhibiendo la traducción a nivel postranscripcional. Para comprender las funciones de los miRNAs y sus genes diana en la reproducción de la poliploidía del crisantemo, se realizaron tres bibliotecas de sRNA de embriones normales y anormales después de la hibridación por RNA-Seq. Como resultado, un total de 170 miRNAs fueron identificados y hay 41 miRNAs especiales en el cruce de la duplicación cromosómica paterna, como miR169b, miR440, y miR528-5p. miR164c y miR159a fueron altamente expresados en un embrión normal a los 18 días después de la polinización, lo que sugiere el papel regulador en la etapa tardía del desarrollo embrionario. Sólo se detectó miR172c en el embrión normal a los 18 días de la polinización, lo que significa que miR172c media principalmente la expresión génica en el desarrollo postembrionario y que estos genes pueden promover la maduración embrionaria. Otros miRNAs, incluyendo miR414, miR2661, y miR5021, pueden regular los genes que participan en las vías de respuesta a la auxina y el metabolismo energético; entonces regulan juntos el complejo desarrollo embrionario.

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