Campylobacter is the most common bacteria causing gastroenteritis in the UK. Although near 280 thousand cases per year are estimated, detected outbreaks are relatively rare. Therefore, mathematical approaches are suitable when exploring notification data to identify epidemics. This report proposes four different methods for detecting potential outbreaks. Three of them are based on the spatiotemporal distribution of reported cases, whilst the last one uses the genetic distances among Campylobacter samples. A sentinel surveillance dataset containing 743 incidents in Oxfordshire in the period April 2010 - March 2011 is used, dataset funded and collected by Public Health England and the Food Standards Agency. Information about spatial and temporal locations is included, as well as the structure of the whole genome. Although some outbreaks are identified in the spatiotemporal analysis, a genome-to-genome comparison among cases is not conclusive. Results obtained based on a genetic distance analysis suggest that the methodology potentially detects outbreaks but future testing and improvements are required.

In the development of parks in Bogota, legacies of conflict pull the environmental and post-conflict equity-building agendas apart. This thesis interrogates the relationship between post-conflict, equity-building and the ecology of public parks in order to propose a framework for the development of green open spaces that advances both agendas simultaneously, through everyday city-making processes. In particular, using a case study of Bogotá’s park system, this research explores the challenges when maximizing the benefits of ecological services, while fostering spatial equity, social cohesion, and civic formation in the development of parks in post-conflict contexts. This thesis employs an inductive research methodology that combines qualitative methods with spatial analysis and case study inquiries to identify key assumptions obscured in the everyday city-making processes. This reveals a phenomenon observable in the development of parks in Bogotá, whereby forces of social exclusion and fear of the other, in combination with ideas of order and security, end up provoking a simultaneous restraint on biodiversity and human diversity. This thesis explores the position of the different actors—both mainstream players and alternative organizations—involved in the design, planning, and operation of parks in Bogotá, and reveals how decision-making tools reinforce their theoretical positions. By doing so, it uncovers competing frameworks and priorities at play in a fragmented institutional context. A selection of exemplary parks, illustrate where legacies of conflict (such as associating nature with crime, and expressing nervousness towards “the other”) still over-determine the ways in which parks are designed, programmed, and maintained. These environmental tensions are mostly present in the development of large parks in ecologically vulnerable areas, and are generated by rigid assumptions that treat ecological functionality and security as mutually exclusive. Simultaneously, small neighborhood parks face class-based social frictions that reflect differences between neighborhood-centric preferences and the function of parks as city services for all, and a trend for increased agency of neighborhood associations threaten to make parks less inclusive. Nevertheless, alternative practices are emerging in the development of natural recreational settings that are promoting ecological conservation, high-use, and civic formation. By identifying opportunities, promoting collaboration, and seeking new processes and decision-making tools, this thesis offers a set of planning strategies and an implementation framework of social inclusion and ecological biodiversity to overcome fear (or perception of fear) and reinforce the potential of parks as peace-building tools. En el desarrollo de parques en Bogotá, legados del conflicto armado provocan distanciamiento de las agendas ambientales y de construcción de equidad para el post-conflicto. Esta tesis investiga la relación entre post-conflicto, construcción de equidad y la ecología de parques públicos, con el fin de proponer un marco conceptual para el desarrollo de espacios públicos verdes que promueva ambas agendas simultáneamente, a través de procesos cotidianos en la creación de ciudades. Particularmente, utilizando el sistema de parques de Bogotá como estudio de caso, esta investigación explora los desafíos para maximizar los beneficios de servicios ecosistémicos, al tiempo que se fomenta la equidad espacial, cohesión social, y formación cívica a través del desarrollo de parques en contextos de post-conflicto. Esta tesis emplea una metodología de investigación inductiva que combina métodos cualitativos, de análisis espacial y casos de estudio para identificar supuestos clave, ocultos en los procesos cotidianos que constituyen la creación de ciudades. Es así como se revela un fenómeno observable en el desarrollo de parques en Bogotá, donde fuerzas de exclusión social y el miedo al otro, combinadas con ideales de orden y seguridad, terminan provocando una restricción simultánea de la biodiversidad y la diversidad humana. Esta tesis explora la posición de los diferentes actores —tanto actores principales como organizaciones alternativas— involucrados en el diseño, planificación y operación de parques en Bogotá, y revela cómo las herramientas de toma de decisiones refuerzan sus respectivas posiciones teóricas. De esta manera, expone las prioridades y los marcos conceptuales que se encuentran enfrentados dentro de un contexto institucional fragmentado. Una selección de parques ejemplares ilustra dónde y cómo legados del conflicto armado (como la asociación de la naturaleza con el crimen y nerviosismo hacia "el otro") aún determinan de forma excesiva la formas en que se diseñan, programan y mantienen los parques. Principalmente en el desarrollo de grandes parques en áreas ecológicamente vulnerables, hay tensiones ambientales latentes que surgen de supuestos rígidos que consideran la funcionalidad ecológica y la seguridad como factores mutuamente excluyentes. Simultáneamente, los pequeños parques vecinales enfrentan fricciones entre clases sociales que reflejan diferencias entre las preferencias de los vecinos y el papel de los parques como parte de la oferta pública de servicios de una ciudad. Adicionalmente, la tendencia en el aumento de las asociaciones de vecinos y su agencia sobre el manejo de parques amenaza con volver los parques menos inclusivos. A pesar de esto, también están surgiendo prácticas alternativas en el desarrollo de entornos recreativos naturales que promueven la conservación ecológica, el alto uso y la educación cívica. Identificando oportunidades, promoviendo la colaboración y proponiendo nuevos procesos y herramientas para la toma de decisiones, esta tesis ofrece un conjunto de estrategias de planificación y un marco conceptual de implementación para promover la inclusión social y la biodiversidad ecológica que permita superar el miedo (o la percepción del miedo) y reforzar el potencial de los parques como herramientas de construcción de la paz.

Providing a useful suggestion of products to online users to increase their consumption on websites is the goal of many companies nowadays. People usually select or purchase a new product based on some friend’s recommendations, comparison of similar products or feedbacks from other users. In order to do all these tasks automatically, a recommender system must be implemented. The recommender systems are tools that provide suggestions that best suit the client’s needs, even when they are not aware of it. That offers of personalized content are based on past behavior and it hooks the customer to keep coming back to the website. In this paper, a movie recommendation mechanism within Netflix will be built. The dataset that was used here consists of over 17K movies and 500K+ customers. The main types of recommender algorithm are Popularity, Collaborative Filtering, Content-based Filtering and Hybrid Approaches. All of them will be introduced in this paper. We will select the algorithms that best fit to the data and we will implement and compare them. Resumen Proporcionar una sugerencia útil de productos a los usuarios para incentivar su consumo en las páginas web es el objetivo de muchas empresas hoy en día. Por lo general, la gente selecciona o compra un nuevo producto basándose en las recomendaciones de algún amigo, en la comparación de productos similares o en los comentarios de otros usuarios. Para poder realizar todas estas tareas automáticamente, se debe implementar un sistema de recomendación. Los sistemas de recomendación son herramientas que proporcionan las sugerencias que mejor se adaptan a las necesidades del cliente, incluso cuando éste no es consciente de ello. Las ofertas de contenido personalizado se basan en el comportamiento del cliente en el pasado e intenta enganchar al cliente para que siga regresando al sitio web. En este trabajo, se construirá un mecanismo de recomendación de películas dentro de Netflix. El conjunto de datos que se utilizó aquí consta de más de 17.000 películas y más de 500.000 clientes. Los principales tipos de algoritmos de recomendación son Popularity, Collaborative Filtering, Content-based Filtering y Hybrid Approaches. Todos ellos serán presentados en este documento. Seleccionamos los algoritmos que mejor se adaptan a los datos y los implementamos y comparamos.

En esta disertación examino las formas en que un grupo de profesionales usa, diseña y entiende mapas digitales usados en proyectos participativos en Madrid, España. Argumento que estos Profesionales de la Participación Pública (PPP) llevan a cabo su experticia al generar y organizar sus relaciones con otros actores y objetos de forma que están, simultáneamente, resaltando su autoridad para generar participación, y distribuyendo su autoridad en el proceso. Mi análisis se centra en sus relaciones con los proyectos comunitarios que están mapeando, con profesionales que trabajan similarmente en el diseño de mapas participativos, y con el mapa digital como tal. Concluyo sugiriendo que una aproximación a la experticia que sea etnográfica y centrada en el objeto nos permite desestabilizar nuestras nociones de participación, el rol de las tecnologías digitales, y nuestro entendimiento de lo que es una perspectiva crítica.

This research explores the new meanings of fatherhood in The Netherlands, how men address their role as active fathers and in the household, considering their responsibilities at work and the influence of traditional gender roles. This work investigates how men are dealing with fatherhood and balancing their work and family lives, the possible consequences in their careers when they are more involved with their children and the household, and how the main discourses about the traditional gender roles still affect the development of an open, public, active and proud fatherhood. This research focuses on fathers and their daily interactions and stories while attempting to balance work and family life, where this new active fatherhood is challenged. Fathering narratives and stories are explored and analyzed in contrast to the main discourse about fatherhood, the traditional gender roles that still affect these processes, and policies and norms in The Netherlands, regarding flexible work and family-work balance. Esta investigación explora los nuevos significados de la paternidad en los Países Bajos, cómo los padres manejan su rol como padres activos y en el hogar, considerando sus responsabilidades en el trabajo y la influencia de los roles de género tradicionales. Este trabajo investiga cómo los hombres están lidiando con su paternidad y al mismo tiempo balanceando el trabajo con la vida familiar, las consecuencias en su carrera profesional cuando están más involucrados en el hogar y con sus hijos, y cómo los discursos tradicionales aún afectan el desarrollo de una paternidad abierta, pública, activa y orgullosa. Asimismo, la presente investigación se enfoca en las interacciones diarias e historias de los padres holandeses, mientras intentan balancear la vida familiar con el trabajo, en donde esta nueva paternidad activa es retada. Las narrativas e historias sobre paternidad son exploradas y analizadas a la luz del discurso tradicional y general sobre paternidad, los roles de género tradicionales que aún afectan estos procesos, y las políticas y normas en los Países Bajos, en cuanto al trabajo flexible y el balance entre vida laboral y la vida personal.

Although the last decades have seen an advance in quality and empowerment for women, there are still numerous challenges to be addressed. Among them, and particularly pressing in cities, are issues of gender-based violence, including sexual harassment in public spaces. Despite the numerous effects street harassment has on women, and the high incidence of it in different countries, this issue has not been broadly studied, and even less so in Global South cities. In this scenario, this study aims to comprehend how women in Bogotá experience sexual harassment in public spaces, specifically focusing on public transport and including vehicles, stations, stops and walking routes to and from their origins or destinations. Focusing on this objective, this study made use of a mixed-method approach, including an online self-completing questionnaire, as well as in-depth semi-structured interviews. The data gathered showed that sexual harassment in public transport – and public space – is widespread in Bogotá, and intersections with age and class play a very important role. Additionally, episodes of sexual harassment are widely underreported, and there is a general perception that reporting is useless, which is supported by accounts of women who have tried to report an incident and have faced several difficulties. Finally, policies proposed so far in Bogotá have been unsuccessful in reducing sexual harassment in public transport and, in many cases, do not tackle the problem. Consequently, a comprehensive set of policies aimed at preventing and reducing sexual harassment in different spaces associated with public transport must be put in place. Aunque en las últimas décadas se ha visto un avance en cuanto a la igualdad y el empoderamiento de las mujeres, aún hay muchos retos por abordar en estos temas. Entre ellos, y especialmente relevantes en las ciudades, están los problemas de violencia de género, incluyendo el acoso sexual en espacios públicos. A pesar de los varios efectos que tiene el acoso callejero en las mujeres, y la alta incidencia de este en distintos países, el tema no se ha estudiado a profundidad, y aún menos en ciudades del mundo en desarrollo. En este escenario, este estudio busca comprender cómo las mujeres en Bogotá experimentan el acoso sexual en los espacios públicos, específicamente enfocándose en el transporte público e incluyendo vehículos, estaciones, paraderos y rutas a pie desde y hacia los orígenes y destinos. Siguiendo este objetivo, el estudio utiliza un enfoque de métodos mixtos, incluyendo una encuesta en línea, así como entrevistas semi-estructuradas en profundidad. La información compilada muestra que el acoso sexual en el transporte público – y el espacio público – es generalizado en Bogotá, y las intersecciones con la edad y clase tienen un rol muy importante. Adicionalmente, los episodios de acoso sexual están ampliamente subreportados, y hay una percepción general de que reportar es inútil, lo cual se refleja en las historias de mujeres que han intentado reportar un incidente y se han enfrentado a múltiples dificultades. Finalmente, las políticas propuestas hasta el momento en Bogotá no han tenido éxito en cuanto a reducir el acoso sexual en el transporte público y, en muchas ocasiones, no abordan el problema. Por lo tanto, es necesario implementar un conjunto completo de políticas que se enfoquen en prevenir y reducir el acoso sexual en los diferentes espacios asociados con el transporte público.

"Study on the kinetic isotope effect (KIE) in alcohol dehydrogenase from thermophilic Bacillus stearothermophilus. The enzyme was expressed and purified in order to measure steady state rate constants (𝑘𝑐𝑎𝑡) for the catalysed reaction of wild type and isotopically labelled enzyme. Five different substrates were employed: 2-Butanol, ethanol, cyclopentanol, acetone and acetaldehyde. KIE was determined using non-competitive method. Rate constants (𝑘𝑐𝑎𝑡) were measured via UV spectroscopy by monitoring the linear increase or decrease of the absorbance of the cofactor NADH as a function of time. Estudio del efecto isotópico cinético (EIC) en alcohol deshidrogenasa termofílica de Bacillus stearothermophilus. La enzima se expresó y purificó para luego medir la constante de velocidad de reacción (𝑘𝑐𝑎𝑡) para la reacción catalizada de la enzima con y sin marcación isotópica. Cinco diferentes substratos se emplearon:2-Butanol, etanol, ciclopentanol, acetona y acetaldehído. EIC se determinó usando el método no competitivo. Las constantes de velocidad de reacción (𝑘𝑐𝑎𝑡) fueron determinadas por medio de espectroscopia-UV monitoreando el incremento o disminución lineal de la absorbancia del cofactor NADH en función del tiempo."

The flood event is a problem that may affect drastically any settlement and can bring dramatic consequences, especially when it is not considered as one of the urbanization dynamics. It is important to reduce floods with measures that can be as simple as self‐preparedness, as well as an integrated long‐term plan. Hence, it is essential to avoid loss of lives taking preventive measures and building a resilience perspective into the population. The present document describes the main concepts that should be taken into consideration to understand the flood risk. Consequently, analyses the current flood risk in Bogota, Colombia and seeks to determine the zones where vulnerable settlements overlay flood hazard areas. Finally, it is examined how flood risk management can be targeted to reduce the risk level and how can the design solutions help to prevent and manage the flood problem within the city. Resumen La inundación es un problema que puede afectar drásticamente cualquier asentamiento y puede traer severas consecuencias, especialmente cuando no se considera como una de las dinámicas de la urbanización. Es importante reducir las inundaciones con medidas que pueden ser tan simples como el autoaprendizaje, así como un plan integrado a largo plazo. Por lo tanto, es esencial evitar la pérdida de vidas tomando medidas preventivas y construyendo una perspectiva de resiliencia en la población. El presente documento describe los conceptos principales que deben tomarse en consideración para comprender el riesgo de inundación. En consecuencia, analiza el riesgo de inundación actual en Bogotá, Colombia y busca determinar las zonas donde los asentamientos vulnerables se sobreponen a las áreas en peligro de inundación. Finalmente, se examina cómo la gestión del riesgo de inundación puede orientarse para reducir sus niveles y cómo las soluciones de diseño pueden ayudar a prevenir y gestionar el problema de inundación dentro de la ciudad.

Insects are essential for the functioning of ecosystems, delivering important ecological functions as nutrient recycling, pest control, pollination, and seed dispersal. Biodiversity increases the multi-functionality and resilience of ecosystems around the world, a valuable effect considering that global change is likely to have an impact on ecosystems globally. In the process of urbanisation, ecosystems are modified and plant and animal communities segregated, affecting biodiversity and thus jeopardising ecosystems in a global scale. Different insect taxa play distinct ecological roles, so assessing how environmental factors associated with urbanisation affect them is relevant for the conservation of biological diversity of cities. The main objective of this research project was to investigate how insect communities are affected by urbanisation, using an integrated multi-taxa and multiscale approach. The research project is divided in two fundamental questions: 1) Are insect communities affected by coarse or fine scale environmental filters? and 2) Are insect´s foraging abilities affected by environmental modification? To address the first question, I sampled four insect taxa (Coleoptera, Diptera, Hemiptera and Hymenoptera) in 19 sites with three levels of environmental modification, and multiple environmental variables associated with urbanisation. For the second question, I used focal plants to sample floral visitors in 19 sites with varying levels of environmental modification, recording the time taken for the focal plant to be discovered by an insect, and the number of insects after 48 hours. My results show that coarse environmental filters affect Hemiptera communities but do not seem to affect Coleoptera, Diptera, or Hymenoptera communities. Fine environmental filters such as proportion of native plants with flowers, site area, and proportion of green space are associated with species richness of coleopteran, dipteran and hymenopteran communities. Floral discoverability was not associated with environmental modification but the number of insects was higher in sites with higher environmental modification. Native floral resources are important for the maintenance of urban biodiversity, thus native plants should be used in urban green. Low species richness of hymenopterans and coleopterans in more urbanised sites indicates the susceptibility of these groups to urbanisation, reflecting what others studies have found in urban contexts worldwide. Environmental modification affects insects’ ability to discover and use floral resources. Where conservation initiatives use floral resource plantings to support biodiversity, environmental modification must be considered, to ensure that target taxa are able to reach the novel resources.

Ship-source oil spills are amongst the major sources of oil affecting coastal areas. An end-to-end marine oil spill analysis may provide a model to better allocate response resources or prepare contingency plans for highly vulnerable zones. A consequence assessment, a key aspect of this type of analysis which considers economic, social and environmental aspects of a geographic area, is presented in this study as a GIS index tool, which can be applied in the context of Atlantic Canada. A theoretical framework and conceptual model is developed based on a literature review of oil spill state-of-the-art analysis using Exploratory Network Analysis; and tested on a realistic case study (Halifax Harbour, NS). The novel approach for reviewing the literature provided sound criteria for the conceptual model, which fits the end-to-end marine oil spill analysis, segregating elements regarding exposure and oil behaviour. Furthermore, oil spill management indicators were tailored using expertise from Atlantic Canada’s oil spill responders, and many gaps were identified to potentially refine the model later. Finally, this model considers the range of aspects that influence the consequences of a ship-based oil spill, using readily available information and considering relevant stakeholder’s interests.