Exclusivo BibloRed
Otros

Classification of Complete Proteomes of Different Organisms and Protein Sets Based on Their Protein Distributions in Terms of Some Key Attributes of Proteins

CONTENIDO PARA USUARIOS REGISTRADOS

Inicia sesión para disfrutar este recurso. Si aún no estás afiliado a BibloRed, haz clic en el botón.

Autor
Año de publicación 2017
Idioma Inglés
Publicado por Revista VirtualPRO,

Descripción: La existencia de secuencias genómicas completas hace que sea importante desarrollar diferentes enfoques para la clasificación de conjuntos de datos a gran escala y facilitar la extracción de conocimientos biológicos. Aquí proponemos un enfoque para la clasificación de proteomas/conjuntos de proteínas completos basado en las distribuciones de proteínas en algunos atributos básicos. Demostramos la utilidad de este enfoque determinando las distribuciones de proteínas en términos de dos atributos: longitudes de proteínas y contenido de desorden intrínseco (ID) de proteínas. Las distribuciones de proteínas basadas en L e ID se estudian para organismos proteómicos representativos y conjuntos de proteínas de los tres dominios de la vida. A continuación, se construyen los mapas bidimensionales (denominados aquí huellas dactilares) a partir de las densidades de distribución de proteínas en el espacio LD definido por ln(L) e ID. Las huellas dactilares de diferentes organismos y conjuntos de proteínas son distintas entre sí, por lo que pueden utilizarse en estudios comparativos. Como caso de prueba, se han construido árboles filogenéticos basados en las densidades de distribución de proteínas en las huellas dactilares de proteomas de organismos sin realizar ninguna comparación de secuencias de proteínas ni alineamientos. Los árboles filogenéticos generados son biológicamente significativos, demostrando que las distribuciones de proteínas en el espacio LD pueden servir como señales filogenéticas únicas de los organismos a nivel del proteoma.
Citación recomendada (normas APA)
: Hindawi, "Classification of Complete Proteomes of Different Organisms and Protein Sets Based on Their Protein Distributions in Terms of Some Key Attributes of Proteins", -:Revista VirtualPRO,, 2017. Consultado en línea en la Biblioteca Digital de Bogotá (https://www.bibliotecadigitaldebogota.gov.co/resources/3892230/), el día 2025-12-18.

Información adicional

Fuente Revista Virtual Pro
Términos y condiciones de uso Más información aquí
Año de publicación 2017

Classification of Complete Proteomes of Different Organisms and Protein Sets Based on Their Protein Distributions in Terms of Some Key Attributes of Proteins

Información adicional

Mis colecciones

¿Eliminar esta reseña?