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Enriching Genomic Resources and Transcriptional Profile Analysis of Miscanthus sinensis under Drought Stress Based on RNA Sequencing

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Autor
Año de publicación 2017
Idioma Inglés
Publicado por Revista VirtualPRO,

Descripción: Miscanthus × giganteus se cultiva ampliamente en todo el mundo como materia prima potencial para biocombustibles; sin embargo, su estrecha base genética y sus características estériles se han convertido en una limitación para su utilización. Como progenitor de M. × giganteus, M. sinensis está ampliamente distribuido por Asia Oriental y presenta una buena tolerancia al estrés abiótico. Para enriquecer las bases de datos y los recursos genómicos de M. sinensis, secuenciamos y anotamos el transcriptoma de M. sinensis utilizando una plataforma Illumina HiSeq 2000. Se generaron aproximadamente 316 millones de lecturas recortadas de alta calidad a partir de 349 millones de lecturas brutas, y se obtuvo un total de 114.747 unigenes tras el ensamblaje de novo. Además, 95.897 (83,57%) unigenes estaban anotados en al menos una base de datos, incluidas NR, Swiss-Prot, KEGG, COG, GO y NT, lo que demuestra que las secuencias obtenidas estaban anotadas correctamente. El análisis de genes expresados diferencialmente indica que los 15 días de estrés por sequía podrían ser un periodo crítico para la respuesta de M. sinensis al estrés por sequía. La secuenciación de alto rendimiento del transcriptoma de M. sinensis bajo estrés por sequía ha enriquecido enormemente los recursos genómicos disponibles en la actualidad. La comparación de los DEGs bajo diferentes periodos de estrés por sequía identificó una gran cantidad de genes candidatos implicados en las redes reguladoras de la tolerancia a la sequía, lo que facilitará la mejora genética y los estudios moleculares de M. sinensis.
Citación recomendada (normas APA)
: Hindawi, "Enriching Genomic Resources and Transcriptional Profile Analysis of Miscanthus sinensis under Drought Stress Based on RNA Sequencing", -:Revista VirtualPRO,, 2017. Consultado en línea en la Biblioteca Digital de Bogotá (https://www.bibliotecadigitaldebogota.gov.co/resources/3892149/), el día 2025-12-20.

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Fuente Revista Virtual Pro
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Año de publicación 2017

Enriching Genomic Resources and Transcriptional Profile Analysis of Miscanthus sinensis under Drought Stress Based on RNA Sequencing

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