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The Draft Genome and Transcriptome of the Atlantic Horseshoe Crab, Limulus polyphemus

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Autor
Año de publicación 2016
Idioma Inglés
Publicado por Revista VirtualPRO,

Descripción: El cangrejo herradura, Limulus polyphemus, exhibe ritmos circadianos y circatidiales robustos, pero se sabe poco sobre los mecanismos moleculares subyacentes a esos ritmos. En este estudio, se recogieron cangrejos herradura durante el día y la noche, así como en mareas altas y bajas, y se procesaron sus tejidos musculares y del sistema nervioso central para secuenciar el genoma y el transcriptoma, respectivamente. El ensamblaje del genoma dio como resultado 7,4 × 10 5 contigs con un N50 de 4.736, mientras que el ensamblaje del transcriptoma dio como resultado 9,3 × 10 4 contigs y un N50 de 3.497. El análisis de la integridad funcional mediante la identificación de ortólogos universales putativos sugiere que el transcriptoma tiene tres veces más ortólogos esperados que el genoma. Curiosamente, el análisis RNA-Seq no indicó cambios estadísticamente significativos en el nivel de expresión de ningún gen circadiano central o accesorio, pero se produjo un ciclado significativo de varios transcritos no circadianos. En general, estos ensamblajes proporcionan un recurso para investigar los sistemas de reloj de Limulus y proporcionan un gran conjunto de datos para una mayor exploración de la taxonomía y la biología del cangrejo herradura del Atlántico.
Citación recomendada (normas APA)
: Hindawi, "The Draft Genome and Transcriptome of the Atlantic Horseshoe Crab, Limulus polyphemus", -:Revista VirtualPRO,, 2016. Consultado en línea en la Biblioteca Digital de Bogotá (https://www.bibliotecadigitaldebogota.gov.co/resources/3892140/), el día 2025-12-20.

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Fuente Revista Virtual Pro
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Año de publicación 2016

The Draft Genome and Transcriptome of the Atlantic Horseshoe Crab, Limulus polyphemus

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