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Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds

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Autor
Año de publicación 2016
Idioma Inglés
Publicado por Revista VirtualPRO,

Descripción: Las series de homocigosis (ROH), tramos ininterrumpidos de genotipos homocigóticos resultantes de la transmisión de haplotipos idénticos por parte de los progenitores a su descendencia, han surgido como estimaciones informativas de la autocigosis (endogamia) en todo el genoma. Hemos utilizado perfiles genómicos basados en 698 K polimorfismos de nucleótido único (SNP) de nueve razas de ganado doméstico (Bos taurus) y del bisonte europeo (Bison bonasus) para investigar cómo pueden compararse las distribuciones de ROH dentro de cada especie y entre especies. Nos centramos en dos clases de longitud 0.5-15 Mb para investigar eventos antiguos y >15 Mb para tratar eventos recientes (aproximadamente tres generaciones). Para cada clase de longitud, elegimos unos pocos cromosomas con un alto número de ROH, calculamos el porcentaje de veces que un SNP aparecía en un ROH y trazamos los resultados. Seleccionamos áreas con patrones distintos, incluyendo regiones en las que (1) todos los grupos revelaban un aumento o disminución de ROH, (2) el bisonte difería del vacuno, (3) una raza de vacuno o grupos de razas diferían (por ejemplo, vacuno de leche frente a vacuno de carne). El examen de estas regiones del genoma bovino mostró genes potencialmente importantes para la selección natural e inducida por el hombre, en relación, por ejemplo, con la calidad de la carne y la leche, el metabolismo, el crecimiento y la función inmunitaria. La metodología comparativa que aquí se presenta permite identificar visualmente regiones de interés para la selección, los programas de cría y la conservación.
Citación recomendada (normas APA)
: Hindawi Publishing Corporation, "Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds", -:Revista VirtualPRO,, 2016. Consultado en línea en la Biblioteca Digital de Bogotá (https://www.bibliotecadigitaldebogota.gov.co/resources/3892023/), el día 2025-12-19.

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Fuente Revista Virtual Pro
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Año de publicación 2016

Novel Graphical Analyses of Runs of Homozygosity among Species and Livestock Breeds

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