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Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus

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Autor
Año de publicación 2014
Idioma Inglés
Publicado por Revista VirtualPRO,

Descripción: Es vital desentrañar el sesgo en el uso de codones para comprender mejor las fuerzas evolutivas que dictan el proceso de evolución viral. El virus de la gripe A ha atraído la atención de muchos investigadores a lo largo de los años debido a su elevada tasa de mutación y al hecho de que en el genoma vírico se produzcan cambios transversales específicos. Varios autores han señalado que el sesgo en el uso de codones es bajo en los virus de la gripe A, citando la presión mutacional como la fuerza decisiva que configura el uso de codones en estos virus. En este estudio, se han explorado las secuencias codificantes completas de los genes de la hemaglutinina del subtipo H1N1 del virus de la gripe A en busca del posible sesgo en el uso de codones que actúa sobre estos genes. Los resultados indican un sesgo general bajo con valores de ENC máximos. El contenido de GC es sustancialmente bajo en comparación con el contenido de AT en los sitios de codones silenciosos. Se observaron correlaciones significativas entre los parámetros de composición y AT3, lo que implica el posible papel de este último en la formación del perfil de uso de codones en la hemaglutinina viral. Los datos mostraron claramente que las secuencias eran redundantes en A y que la mayoría de los codones preferían el nucleótido A a otros en el tercer codón sinónimo. Los resultados indicaron el papel fundamental de la presión composicional que afecta al uso de codones en este virus.
Citación recomendada (normas APA)
: Hindawi Publishing Corporation, "Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus", -:Revista VirtualPRO,, 2014. Consultado en línea en la Biblioteca Digital de Bogotá (https://www.bibliotecadigitaldebogota.gov.co/resources/3891923/), el día 2025-10-20.

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Fuente Revista Virtual Pro
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Año de publicación 2014

Compositional Constraint Is the Key Force in Shaping Codon Usage Bias in Hemagglutinin Gene in H1N1 Subtype of Influenza A Virus

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