Abstract: Objectives: The objectives of the study were to estimate the prevalence of different clinical signs of trachoma and identify possible factors associated with TF. Methodology: Following the approval of the study protocol by the ethics committee, a cross- sectional study was conducted in Vaupe’s, a department of the Colombian Amazon, between the years 2012 and 2013 in two districts. Based on the records obtained from a standardized format for the clinical evaluation of the participants and the factors associated with follicular trachoma, an excel database was built and debugged, which was analyzed using IBM SPSS, Statistics Version 23 and Stata STATA (Version 14, 2015, StataCorp LLC, Texas, USA). Results: The records of 13,091 individuals was collected from 216 rural indigenous communities, of which 12,080 were examined (92.3%); 7,274 in the Western and 4,806 in the Eastern districts. A prevalence of trachomatous inflammation–follicular (TF) of 21.7% (n = 599; 95% CI 20.2–23.3) in the Western and 24.9% (n = 483; 95% CI 23.1–26.9) in the Eastern district was found in children aged 1 to 9 years. Regarding trachomatous trichiasis (TT), 77 cases were found, of which 14 belonged to the Western district (prevalence 0.3%, CI 95% 0.2–0.5) and 63 to the Eastern district (1.8%, CI 95% 1.4–2.4). Children aged between 1 to 9 years were significantly more likely to have TF when there was the presence of secretions on the face (OR: 3.2; 95% CI: 2.6–3.9). Conclusions: Trachoma is a public health problem in Vaupes that requires the implementation of the SAFE strategy (S = Surgery, A = Antibiotics, F = Face Washing, E = Environment) in the Eastern and Western districts, for at least 3 consecutive years, in accordance with WHO recommendations. Resumen: Objetivos: Los objetivos del estudio fueron estimar la prevalencia de diferentes signos clínicos de tracoma e identificar posibles factores asociados al TF. Metodología: Tras la aprobación del protocolo de estudio por parte del comité de ética, se realizó un estudio transversal en Vaupés, departamento de la Amazonía colombiana, entre los años 2012 y 2013 en dos distritos. A partir de los registros obtenidos de un formato estandarizado para la evaluación clínica de los participantes y los factores asociados al tracoma folicular, se construyó y depuró una base de datos en Excel, la cual fue analizada utilizando IBM SPSS, Statistics Versión 23 y Stata STATA (Versión 14, 2015, StataCorp LLC, Texas, EE. UU.). Resultados: Se recolectaron los registros de 13.091 individuos de 216 comunidades indígenas rurales, de los cuales se examinaron 12.080 (92,3%); 7.274 en los distritos occidentales y 4.806 en los orientales. Se encontró una prevalencia de inflamación tracomatosa-folicular (TF) del 21,7% (n = 599; IC del 95% 20,2-23,3) en el occidental y del 24,9% (n = 483; IC del 95% 23,1-26,9) en el distrito del oriental en niños de 1 a 9 años. En cuanto a la triquiasis tracomatosa (TT), se encontraron 77 casos, de los cuales 14 pertenecían al distrito occidental (prevalencia 0,3%, IC 95% 0,2-0,5) y 63 al distrito oriental (1,8%, IC 95% 1,4-2,4). Los niños de entre 1 y 9 años tenían una probabilidad significativamente mayor de tener TF cuando había presencia de secreciones en la cara (OR: 3,2; IC del 95%: 2,6–3,9). Conclusiones: El tracoma es un problema de salud pública en Vaupés que requiere la implementación de la estrategia SAFE (S = Cirugía, A = Antibióticos, F = Lavado de Cara, E = Medio Ambiente) en los distritos oriental y occidental, por al menos 3 años consecutivos de acuerdo con las recomendaciones de la OMS.

Resumen: Introducción: Numerosos estudios poblacionales han demostrado la asociación entre diversos factores perinatales y postnatales con el desarrollo de obesidad infantil. Sin embargo, no se conoce en detalle si esos factores determinan el grado de severidad de dicha obesidad. Objetivos: 1. Determinar los factores perinatales (antecedentes maternos y del embarazo) y postnatales que pueden influir en la severidad de la obesidad a los 7-11 años de edad. 2. Evaluar si los factores perinatales que se relacionan con la severidad de la obesidad a los 7-11 años siguen influyendo en el grado de obesidad 5 años más tarde. Materiales y Métodos: El estudio consta de 2 partes: una primera parte retrospectiva, en la que se analizaron datos antropométricos y antecedentes perinatales de pacientes entre 6 y 12 años de edad con obesidad (z-score IMC >2.0 desviaciones estándar) visitados en la Unidad de Obesidad del Hospital Sant Joan de Déu de Barcelona entre el 2014 y 2019. La segunda parte fue transversal prospectiva, en la que se contactaron estos mismos pacientes y se citaron 5 años después para tomar nuevos datos antropométricos y de laboratorio. Resultados: Parte Retrospectiva: Se obtuvieron datos clínicos y antropométricos de 120 pacientes, el 58% de sexo femenino, media (DE) de edad de 9.6±1.5 años y de z-score IMC de 3.24±0.92 kg/m2, el 67% eran prepuberales. Se detectó antecedente materno de obesidad en el 56% de los participantes, diabetes gestacional en el 13% y tabaquismo durante el embarazo en el 20%. El 66% nacieron por parto vaginal y el 43% recibió lactancia materna exclusiva los primeros 4 meses de vida. De los antecedentes perinatales, la Obesidad materna tuvo un efecto significativo con el grado de obesidad en la visita inicial. Se observó un aumento progresivo del z-score de peso durante los 2 primeros años de vida, siendo de 0.10±0.97 al nacimiento, e incrementando a 0.37±1.05, 0.90±1.13 y 1.19±1.20 a los 6, 12 y 24 meses de vida, respectivamente. Mediante regresiones lineales multivariantes, observamos que tanto el incremento de z-score de peso entre 0 y 6 meses (B=0.18, CI: 0.04 - 0.32, p= 0.010) como entre 6 y 12 meses (B=0.21, CI: 0.03 - 0.39, p= 0.020) estaban significativamente asociados al z-score IMC actual. En cambio, la diferencia de z-score de peso entre 12 y 24 meses no guardaba correlación ninguna con el z-score IMC actual (B=0.00, CI: -0.21 - 0.21, p= 0.996). Parte Prospectiva: Participaron 21 pacientes, edad promedio 14.6 + 1.3 años, IMC 2.27 ± 0.77 kg/m2, todos puberales. En este subgrupo de pacientes, se encontró igualmente que el incremento del z-score del peso entre 0 y 6 meses (B=0.44, CI: 0.03 - 0.84, p= 0.038) estaba asociado al grado del z-score del IMC. El incremento de peso entre 6 y 12 meses y 12 y 24 meses no tuvo una asociación significativa con el grado de obesidad (B=0.10, CI: -0.57 - 0.77, p= 0.748 y B=0.03, CI: -0.67 - 0.73, p= 0.923, respectivamente). Conclusiones: En esta cohorte de niños con obesidad, la ganancia de peso durante el primer año de vida y la obesidad materna se asociaron al grado de obesidad a los 7-11 años de edad. Igualmente, la ganancia de peso de los primeros 6 meses de vida influyó en el grado de obesidad a los 5 años del seguimiento. La ganancia de peso de los 12 a 24 meses no se relacionó con el grado de obesidad infantil. La implementación de medidas preventivas ya desde el primer año de vida puede ser una estrategia a tener en cuenta para combatir la obesidad infantil.

Resumen: El carcinoma pulmonar es la causa más frecuente de muerte por tumores y el cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPCNP) constituye aproximadamente el 85% de los tumores malignos de pulmón. La incidencia y severidad de este tipo de cáncer aumenta de forma constante y sólo un 13% de los pacientes se encuentran vivos a los cinco años. El efecto que tienen las diferentes opciones terapéuticas junto a los efectos directos de la enfermedad como la fatiga, la disnea, la pérdida de peso y el dolor, combinados con los efectos indirectos del tratamiento oncológico, inducen progresivamente a un deterioro de la capacidad funcional que impacta en la calidad de vida y bienestar emocional. En este sentido, se ha sugerido que el ejercicio físico supervisado puede reducir los síntomas, incrementar la tolerancia al ejercicio y mejorar la calidad de vida. Sin embargo, en pacientes con CPCNP avanzado no existe suficiente evidencia científica sobre el efecto que pueda tener un programa de ejercicio físico que incluya ejercicios de fuerza muscular, resistencia, flexibilidad y equilibrio. Por último, no se conoce la efectividad de programas con ejercicios multicomponente para mejorar resultados, como la capacidad funcional, disnea, la fatiga y la calidad de vida en el contexto de oncogeriatría basada en intervenciones no farmacológicas. En esta Tesis doctoral, se presentan los resultados de dos estudios: una revisión sistemática y un estudio clínico que examina el impacto de intervenciones con programas de ejercicio físico multicomponente en la prevención del deterioro funcional y la mejora del estado cognitivo y la calidad de vida en adultos mayores con CPCNP en las fases de prehabilitación, tratamiento adyuvante y paliativo.

Abstract: The amygdala is a key hub for the acquisition, storage and extinction of fear memories, which are important in adaptive behaviors. The intercalated cell clusters (ITCs) are groups of inhibitory cells within the amygdaloid complex that have been recently shown to play an important role in fear-related states, especially in the context of fear extinction. Apart from the canonical view that points ITCs as feedforward and feedback inhibitors between the input and output stations towards motor centers, it has been starting to suggest that they could have diverse outputs to different regions beyond the amygdaloid complex. Although some preliminary studies have given some indications of this potential new role of the ITCs, indicating an increase in the complexity of their function in fear behavior and emotional processing, very little is still known. In this thesis, two ITC clusters –lateral and dorsomedial– are the object of the study and two main questions are addressed: (1) Do lateral and dorsomedial ITCs (latITCs and dmITCs) extend long-range projections towards the non-lemniscal (NL) thalamus and the dopaminergic (DA) midbrain? If yes, are their innervation patterns different from each other across these structures? I evaluated the outward latITCs and dmITCs projections to the NL-thalamic and DA-midbrain subnuclei, using anterograde tracing upon Cre-dependent expression of ChR2-EYFP in FoxP2-Cre transgenic mice and less extensively, using retrograde tracing to confirm the results from the anterograde tracing. With these methodological approaches I showed that latITCs and dmITCs do send long-range projections in a differential fashion towards the distinct examined subnuclei. I also showed that these projections are inhibitory (most likely GABAergic) and also, that to assess the innervation pattern, it is necessary to make either automated counting of the fibers, or measure the general innervation in terms of at least two variables–area coverage and fibers’ density– that indirectly provide a more comprehensive innervation index. Resumen: La amígdala es un centro fundamental en la adquisición, almacenamiento y extinción de memorias de miedo, que son importantes para los comportamientos adaptativos. Los grupos de células intercaladas (ITCs) se localizan del complejo de la amígdala, y la regulación inhibitoria sobre ésta, ha demostrado demostrado tener un papel importante en los estados relacionados con el miedo, especialmente en el contexto de la extinción. Aparte de la visión canónica que señala a las ITCs como inhibidores retroalimentadores y proalimentadores entre las estaciones de input y output hacia los centros motores, se ha empezado a sugerir que podrían tener diversas salidas hacia diferentes regiones más allá del complejo de la amígdala. A pesar de que algunos estudios preliminares han dado algunos indicios que soportan este nuevo rol de las ITCs, indicando un aumento de la complejidad de su función en el comportamiento del miedo y el procesamiento emocional, actualmente se conoce muy poco sobre este rol extendido. En esta tesis, dos grupos de células intercaladas diferentes -lateral y dorsomedial- son objeto de estudio y se abordan dos cuestiones principales (1) ¿Los ITCs laterales y dorsomediales (latITCs y dmITCs) extienden proyecciones extendidas hacia núcleos no lemniscales del tálamo (NL) y el cerebro medio dopaminérgico (DA)? En caso de hacerlo, ¿se presenta un patrón inervación diferencial hacia estas estructuras? Para responder esto, he evaluado las proyecciones de los grupos latITCs y dmITCs hacia múltiples subnúcleos del tálamo no lemniscal y del mesencéfalo dopaminérgico, utilizando el trazado viral anterógrado tras la expresión de ChR2-EYFP, que es dependiente del sistema Cre, en ratones transgénicos FoxP2-Cre y, de forma menos extensa, utilizando el trazado retrógrado para confirmar los resultados del trazado anterógrado. Con estos enfoques metodológicos me fue posible demostrar que los grupos de latITCs y dmITCs envían proyecciones extendidas hacia los distintos subnúcleos examinados, de forma diferencial. También demostré que estas proyecciones son inhibitorias (muy probablemente GABAérgicas) y también, que para evaluar el patrón de inervación, es necesario hacer un recuento automatizado de las fibras (por medio de un algoritmo), o medir la inervación general en términos de al menos dos variables -cobertura de área y densidad de fibras- que de forma indirecta, proporcionan un índice de inervación más completo.

Resumen: El síndrome Cornelia de Lange (SCdL) es un desorden congénito del desarrollo, que cursa con dismorfia facial, retraso de crecimiento y psicomotor, reducción de las extremidades, hirsutismo y afectación variable de otros aparatos o sistemas. Tiene una prevalencia baja estimándose en 1 de cada 15000 nacidos vivos, por lo que ha sido considerado como una enfermedad rara. Se conocen cinco genes causales (NIPBL , SMC1A, SMC3, HDAC8 y RAD21) que codifican proteínas reguladoras y estructurales del complejo de cohesinas. La ausencia de diagnóstico en cerca del 30% de los pacientes y la gran variabilidad fenotípica, ha sugerido la existencia de otros genes responsables, y quizás también la implicación de otros mecanismos moleculares. El reciente descubrimiento de que NIPBL podía actuar como una proteína remodeladora de la cromatina, ha hecho proponer que el SCdL debería ser considerado más un Desorden de la Cromatina que una Cohesinopatía. El objetivo general de esta memoria ha sido establecer nuevas correlaciones genotipofenotipo dentro del espectro del Síndrome Cornelia de Lange. Para ello se han estudiado casos atípicos que, muchas veces, tenían alteraciones moleculares únicas. Todo ello ha servido para buscar una explicación a la gran heterogeneidad clínica del síndrome. Como método de trabajo se han realizado historias clínicas exhaustivas, acompañadas de exploraciones físicas detalladas y de pruebas complementarias. Asimismo, se han evaluado alteraciones moleculares como variaciones en el número de copias de genes, presencia de mosaicismo somático o coexistencia de más de un síndrome. Además, el uso de nuevas tecnologías como la secuenciación masiva o paneles específicos, ha permitido proponer aproximaciones diagnósticas efectivas y novedosas para estos pacientes. En el primer trabajo se hace una descripción clínica detallada de un paciente portador de una duplicación en el gen SMC1A. A través de estudios como el cariotipo de alta resolución, el HGC y el Western blot, se confirma que la duplicación está incluida dentro de un cromosoma marcador y que produce un aumento de expresión de la proteína. Sin embargo, a pesar de que este gen es uno de los causales del SCdL, la Gestalt del paciente lo aleja de este cuadro y su fenotipo solo ha podido ser considerado como el de una cohesinopatía sin tipificar. En el segundo trabajo, se evalúa a un sujeto con SCdL y mutación en NIPBL, que presenta uno fenotipo nuevo de reducción de extremidades, caracterizado por afectación ipsilateral derecha con agenesia de peroné e hipoplasia de tibia. El estudio por pirosecuenciación en muestras de diferente origen embrionario descarta un posible mosaicismo somático. Además, la utilización de HCG y la secuenciación masiva confirman la falta de implicación de otros genes causales. Estos hallazgos amplían nuestro conocimiento sobre los defectos de reducción que pueden acompañar al síndrome. En el tercer trabajo se describe como gracias a las nuevas técnicas de secuenciación masiva se diagnóstica un paciente con SCdL y mosaicismo somático del gen NIPBL. Inicialmente, el paciente fue estudiado mediante secuenciación Sanger con resultado negativo. Sin embargo, el hallazgo de la mutación mediante técnicas de secuenciación masiva, sirvió para reforzar la idea, de que parte de los pacientes no diagnosticados podrían padecer una mutación en estado mosaico, y de que las técnicas más adecuadas para descubrirlo, serían, combinar la secuenciación masiva con el estudio de ADN de células epiteliales de mucosa oral o fibroblastos. En el último trabajo se describe una paciente con SCdL y Síndrome de Turner en estado mosaico. Esta coincidencia y la observación de que el Turner es posterior temporalmente a la mutación de NIPBL, sirve para sugerir la hipótesis, de que las mutaciones del complejo de cohesinas podrían estar relacionadas con alteraciones en el reordenamiento cromosómico.

Abstract: Latin American countries are experiencing a significant increase in the reports of mistreatment that women experience while using the maternity healthcare services, a phenomenon acknowledged as “Obstetric Violence” (OV). The Latin American region is crucial for the recognition of OV, not only because the term OV was originated there, but also because of its particular response to the matter. The present Scoping Review aimed to identify and review the available evidence about the response of Latin American countries to OV. As a result, it was found, firstly, that the emergence of the concept of OV in Latin America demonstrated to be a transformative tool useful to raise awareness about the mistreatment women face when giving birth. This OV concept also positions this problematic as subset of gendered violence and as a type of structural violence, through which the need to address it systemically is highlighted. Secondly, the used categorization of OV appears to be the broadest and more inclusive typology, emphasizing that OV might stem from both intentional and unintentional actions of healthcare professionals, as well as from conditions within healthcare organizations. Moreover, the identified variables that influence the response to OV in Latin America were synthetized into a theoretical framework, which offers insight into how the problem has been addressed until now and subsequently, provides useful lessons for other countries seeking approaches to combat mistreatment of women during childbirth. Lastly, it was determined that, in order to address OV and allow the progression of public policies to become regionally available, a broadened view encompassing a human rights-based approach is necessary. This research allowed to conclude that OV is a multi-faceted and complex phenomenon whose solution requires a multidimensional and multidisciplinary approach. Furthermore, OV should be understood as more than a simple act of mistreatment, but rather be viewed as a set of socially constructed symbolic, and violent, meanings allowing different stakeholders to reframe the abuse and violence that women undergoing childbirth experience as natural, expected, and accepted, reinforcing specific gender dynamics not merely in maternity care but in society overall. Finally, the framework to tackle OV within the human rights approach developed by the author is expected to be advantageous for the development of further research, programs, and policies to prevent OV in Latin America and beyond.

Abstract: Mixed microbial cultures have become a preferred choice of biocatalyst for chain elongation systems due to their ability to convert complex substrates into medium chain carboxylates. However, the complexity of the effects of process parameters on the microbial metabolic networks is a drawback that makes the task of optimizing product selectivity challenging. Here, we studied the effects of small air contaminations on the microbial community dynamics and the product formation in anaerobic bioreactors fed with lactate, acetate and H2/CO2. Two stirred tank reactors and two bubble column reactors were operated with H2/CO2 gas recirculation for 139 and 116 days, respectively, at pH 6.0 and 32°C with a hydraulic retention time of 14 days. One reactor of each type had periods with air contamination (between 97 ± 28 and 474 ± 33 mL O2 L−1 d−1, lasting from 4 to 32 days), while the control reactors were kept anoxic. During air contamination, production of n-caproate and CH4 was strongly inhibited, whereas no clear effect on nbutyrate production was observed. In a period with detectable O2 concentrations that went up to 18%, facultative anaerobes of the genus Rummeliibacillus became predominant and only n-butyrate was produced. However, at low air contamination rates and with O2 below the detection level, Coriobacteriia and Actinobacteria gained a competitive advantage over Clostridia and Methanobacteria, and propionate production rates increased to 0.8–1.8 mmol L−1 d−1 depending on the reactor (control reactors 0.1–0.8 mmol L−1 d−1). Moreover, i-butyrate production was observed, but only when Methanobacteria abundances were low and, consequently, H2 availability was high. After air contamination stopped completely, production of n-caproate and CH4 recovered, with n-caproate production rates of 1.4–1.8 mmol L−1 d−1 (control 0.7–2.1 mmol L−1 d−1). The results underline the importance of keeping strictly anaerobic conditions in fermenters when consistent n-caproate production is the goal. Beyond that, micro-aeration should be further tested as a controllable process parameter to shape the reactor microbiome. When odd-chain carboxylates are desired, further studies can develop strategies for their targeted production by applying micro-aerobic conditions.

Abstract: Botulism is caused by a potent neurotoxin that blocks neuromuscular transmission, resulting in death by asphyxiation. Currently, the therapeutic options are limited and there is no antidote. Here, we harness the structural and trafficking properties of an atoxic derivative of botulinum neurotoxin (BoNT) to transport a function-blocking single-domain antibody into the neuronal cytosol where it can inhibit BoNT serotype A (BoNT/A1) molecular toxicity. Post-symptomatic treatment relieved toxic signs of botulism and rescued mice, guinea pigs, and nonhuman primates after lethal BoNT/A1 challenge. This platform might enable delivery of antibodies and other protein-based therapeutics to previously inaccessible intraneuronal targets. Resumen: El botulismo es causado por una potente neurotoxina que bloquea la transmisión neuromuscular, provocando la muerte por asfixiamiento. Actualmente, las opciones de tratamiento son limitadas y no existe un antídoto. En este artículo aprovechamos las propiedades estructurales y de tráfico neuronal de un derivado atóxico de la neurotoxina botulínica (BoNT) para transportar un anticuerpo que bloquea la función al citosol neuronal, donde puede inhibir la toxicidad molecular del serotipo A de la BoNT (BoNT /A1). El tratamiento post-sintomático alivió los signos tóxicos del botulismo y rescató de la muerte a ratones, conejillos de indias y primates no humanos después de la exposición letal a BoNT / A1. Esta plataforma podría permitir la administración de anticuerpos y otros terapéuticos basados en proteínas a blancos intraneuronales que previamente eran inaccesibles.

Abstract: The disorders caused by mutations in genes encoding subunits and accessory proteins of cohesin complex are collectively termed as cohesinopathies. The best known cohesinopathy is Cornelia de Lange Syndrome (CdLS), which is a multisystem developmental disorder characterized by facial dysmorphism, limb malformations, growth and cognitive impairment. Mutations in five genes, encoding subunits of the cohesin complex (SMC1A, SMC3, RAD21) and its regulators (NIPBL, HDAC8), are responsible for ∼70% of CdLS cases. We describe a 16-year-old boy with facial dysmorphism, growth retardation, intellectual disability, hirsutism and small hands, who has a small Supernumerary Marker Chromosome (sSMC) present in mosaic form. sSMC is composed of two duplicated segments encompassing 17 genes including SMC1A gene, at the regions Xp11.22 and Xp11.21q11.1. Clinical comparison between our patient with a previously reported individual with a SMC1A duplication and four male carriers of similar sSMC reported in databases, suggest that they all share clinical features related to cohesinopathies. Although our patient does not have the classical CdLS craniofacial phenotype, he has pre and postnatal growth retardation, intellectual disability and mild musculoskeletal anomalies, features commonly seen in patients with cohesinopathies.

Abstract: Cornelia de Lange Syndrome (CdLS) is a congenital autosomal dominant (NIPBL, SMC3 and RAD21) or Xlinked (SMC1A and HDAC8) disorder characterized by facial dysmorphism, pre and postnatal growth retardation, developmental delay and/or intellectual disability, and multiorgan involvement. Musculoskeletal malformations are usually bilateral and affect mainly the upper limbs; the range goes from brachyclinodactyly to severe reduction defects. Instead lower extremities are usually less and mildly involved. Here, we report on a 3-year-old Senegalese boy with typical craniofacial CdLS features, pre and postnatal growth retardation, atrial septal defect, developmental delay and right ipsilateral limb malformations, consistent with oligodactyly of the 3rd and 4th fingers, tibial agenesis and fibula hypoplasia. Exome sequencing and Sanger sequencing showed a novel missense mutation in NIPBL gene (c.6647A>G; p.(Tyr2216Cys)), which affects a conserved residue located within NIPBL HEAT repeat elements. Pyrosequencing analysis of NIPBL gene, disclosed similar levels of wild-type and mutated alleles in DNA and RNA samples from all tissues analyzed (oral mucosa epithelial cells, peripheral blood leukocytes and fibroblasts). These findings indicated the absence of somatic mosaicism, despite of the segmental asymmetry of the limbs, and confirmed biallelic expression for NIPBL transcripts, respectively. Additionally, conditions like Split-hand/foot malformation with long-bone deficiency secondary to duplication of BHLHA9 gene have been ruled out by the array-CGH and MLPA analysis. To our knowledge, this is the first CdLS patient described with major ipsilateral malformations of both the upper and lower extremities, that even though this finding could be due to a random event, expands the spectrum of limb reduction defects in CdLS.