El glioblastoma es el tumor cerebral más agresivo e, incluso con la terapia multimodal actual, es un cáncer invariablemente letal con una esperanza de vida que depende del subtipo de tumor pero que, incluso en los casos más favorables, rara vez supera los 2 años. Los factores epigenéticos desempeñan un papel importante en la gliomagénesis, son fuertes predictores del desenlace y son determinantes importantes de la resistencia a la radio y la quimioterapia. La última incorporación a la maquinaria epigenética son los ARN no codificantes (ARNnc), es decir, moléculas de ARN que no se traducen en una proteína y que ejercen su función por emparejamiento de bases con otros ácidos nucleicos de modo reversible y no mutacional. Los microARN (miARN) son una clase de ARNnc de unos 22 pb que regulan la expresión génica uniéndose a secuencias complementarias en el ARNm y silencian su traducción a proteínas. Los microRNAs regulan reversiblemente la transcripción a través de mecanismos no mutacionales; en consecuencia, pueden ser considerados como efectores epigenéticos. En esta revisión, discutiremos el papel de los miARN en el glioma centrándonos en su papel en la resistencia a fármacos y en sus potenciales aplicaciones en la terapia de este tumor.

Este artículo presenta un intento de analizar el impacto de las condiciones globales en la funcionalidad de la industria siderúrgica país - miembro de la Unión Europea. El documento presenta datos que describen las tendencias y fenómenos que ocurren en la industria siderúrgica mundial, y los indicadores económicos seleccionados que describen la situación económica, lo que permitió la comparación de los cambios locales con las tendencias reveladas en la escala europea y mundial.INTRODUCCIÓNDesde el 1 de mayo de 2004 Polonia es miembro de pleno derecho de la Unión Europea. Entre los mayores beneficios obtenidos por Polonia gracias a su pertenencia a la UE, los más mencionados incluyen la participación en la toma de decisiones económicas y políticas a nivel europeo y la transferencia de recursos fi nancieros que ya han supuesto más de 100.000 millones de euros de ayuda a fondo perdido. Se calcula que el apoyo de la UE a las inversiones ha contribuido a aumentar el PNB (Producto Nacional Bruto) en más de un punto porcentual en los últimos años. [1]Además de crear oportunidades de desarrollo, la integración también ha supuesto una serie de retos. En opinión de los empresarios, los más importantes son una mayor competencia en el mercado nacional, la salida al extranjero de trabajadores cualificados y la necesidad de adaptar las empresas a los requisitos de calidad de la UE. Otro impedimento es el retraso en la introducción del euro (obligación prevista en el Tratado de Adhesión), que dificulta la entrada de inversiones directas debido al riesgo asociado al tipo de cambio. Es probable que la actual crisis mundial retrase aún más este proceso [2].La crisis económica ha afectado significativamente al volumen de producción de las empresas metalúrgicas de toda Europa. De los datos presentados en la Figura 1 se desprende una reducción considerable del número de toneladas de acero en los principales fabricantes de acero de Europa. Sin embargo, desde 1010 se observa una tendencia creciente.En la metalurgia polaca también se observa un fenómeno similar (figura 2). En primer lugar, se ha producido un cambio notable en la estructura de fabricación, dentro de la cual se aprecia claramente un aumento significativo del papel del proceso eléctrico. En segundo lugar, ha aumentado el nivel de consumo explícito de acero, lo que, lamentablemente, se ha reflejado en un empeoramiento del indicador que describe la relación entre importación y exportación, no sólo en la dimensión de línea de productos, sino también en la económica (la exportación incluye productos poco transformados, mientras que la importación se refiere en gran medida a productos muy transformados).Un elemento que indica buenas perspectivas en la industria siderúrgica son también los cambios en el valor del índice SWIP (Steel Weighted Industrial Production), que relaciona el nivel de actividad productiva de los sectores consumidores de productos siderúrgicos con el consumo nacional de acero.

Paeonia lactiflora es una flor herbácea de la familia Paeoniaceae con semillas latentes tanto en el hipocótilo como en el epicótilo. Se utilizó la secuenciación del transcriptoma de alto rendimiento en dos etapas diferentes de desarrollo de las semillas de P. lactiflora para identificar la latencia de las semillas y los genes relacionados con la germinación. Realizamos un ensamblaje de novo y anotamos un total de 123.577 unigenes, que codificaban 24.688 proteínas putativas con 47 categorías GO. Se anotaron un total de 10.714 unigenes en la base de datos KEGG, y 258 vías estaban implicadas en las anotaciones. En el análisis de enriquecimiento funcional se expresaron de forma diferencial un total de 1.795 genes. Los genes clave para la germinación y la latencia de las semillas, como GAI1 y ARF, se confirmaron mediante el análisis cuantitativo de la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa. Este es el primer informe de secuenciación del transcriptoma de semillas de P. lactiflora. Nuestros resultados proporcionan un marco fundamental y apoyo técnico para la mejora selectiva y el cultivo de Paeonia. Nuestros datos transcriptómicos también sirven de base para futuras investigaciones genéticas y genómicas sobre Paeonia y sus especies estrechamente relacionadas.

Varios estudios demostraron que la expresión alterada del miARN-oma en la circulación materna o en el tejido placentario puede reflejar no sólo trastornos gestacionales, como la preeclampsia, el aborto espontáneo, el parto prematuro, el bajo peso al nacer o la macrosomía, sino también la exposición prenatal a contaminantes ambientales. Por lo general, las relaciones entre la exposición ambiental, los cambios en la expresión de miARN y los trastornos gestacionales se exploran por separado, lo que produce resultados contradictorios. Sin embargo, la validación de biomarcadores accesibles a los tejidos para el seguimiento de los resultados adversos del embarazo requiere un enfoque metodológico sistemático que tenga también en cuenta la exposición ambiental en las primeras etapas de la vida. Para lograr este objetivo, debe evaluarse la exposición a xenoquímicos, agentes endógenos y la dieta. Este estudio tiene como objetivo proporcionar una revisión exhaustiva sobre el papel de los miRNAs como biomarcadores potenciales de los resultados adversos del embarazo y la exposición ambiental prenatal.

La jatrofa (Jatropha curcas L.) es una especie de importancia económica con un gran potencial para la producción de biodiésel. Con el fin de enriquecer las bases de datos y los recursos genómicos de la jatropha para estudios en microgravedad, secuenciamos y anotamos el transcriptoma de la jatropha y desarrollamos marcadores SSR y SNP a partir de las secuencias del transcriptoma. En total, se generaron 1.714.433 lecturas brutas con una longitud media de 441,2 nucleótidos. El ensamblaje de novo y la agrupación dieron como resultado 115.611 secuencias ensambladas de forma única (UASs), incluyendo 21.418 cDNAs de longitud completa y 23.264 nuevas secuencias de transcripción de jatropha. Todo el conjunto de UASs fue completamente anotado, de los cuales 59.903 (51,81%) fueron asignados con la ontología de genes (GO) término, 12.584 (10,88%) tenían orthologs en Eukaryotic Orthologous Groups (KOG), y 8.822 (7,63%) se asignaron a 317 vías en seis categorías diferentes en Kyoto Enciclopedia de Genes y Genoma (KEGG) base de datos, y que contenía 3.588 factores de transcripción putativos. A partir de los UAS, se descubrieron 9.798 SSR, siendo AG/CT el tipo de motivo SSR más frecuente (45,8%). Además, se detectaron 38.693 SNP, de los que 7.584 permanecieron tras el filtrado. Este conjunto de UAS ha enriquecido las bases de datos genómicos actuales de la jatrofa y ha proporcionado un gran número de marcadores genéticos, que pueden facilitar la mejora genética de la jatrofa y muchos otros estudios genéticos y biológicos.

La composición genética de la mayoría de las bacterias está codificada en un solo cromosoma, mientras que alrededor del 10% tienen más de un cromosoma. Entre éstas, Vibrio cholerae, con dos cromosomas, ha servido como sistema modelo para estudiar diversos aspectos del mantenimiento cromosómico, principalmente la replicación, y la partición fiel de genomas multipartitos. Aquí describimos la caracterización genómica de cepas que constituyen una excepción a las reglas de los dos cromosomas: el V. cholerae monocromosómico natural. Los análisis de la secuencia del genoma completo de NSCV1 y NSCV2 (vibrio monocromosómico natural) revelaron que las uniones de fusión Chr1 y Chr2 contienen profagos, elementos IS y repeticiones directas, además de reordenamientos cromosómicos a gran escala como inversiones, inserciones y repeticiones largas en tándem en otras partes del cromosoma, en comparación con los genomas prototípicos de dos cromosomas de V. cholerae. Muchos de los factores de virulencia conocidos del cólera están ausentes. Los dos orígenes de replicación y los genes asociados están generalmente intactos, con mutaciones sinónimas en algunos genes, al igual que recA y los genes de reparación de emparejamientos erróneos (MMR) dam, mutH y mutL; la función MutS está probablemente alterada en NSCV2. Estas cepas son herramientas ideales para estudiar los aspectos mecánicos del mantenimiento de cromosomas con múltiples orígenes y otros reordenamientos, así como la importancia biológica, funcional y evolutiva de la arquitectura genómica multipartita en general.

Se ha demostrado una regulación al alza dependiente de la dosis de la mayoría de los genes del cromosoma 21 (Hsa21) en los tejidos cardíacos de fetos con síndrome de Down (SD). Además, los miARN podrían desempeñar un papel importante en el fenotipo cardiaco, ya que se expresan en gran medida en el corazón y regulan el desarrollo cardiaco. Cinco miARNs Hsa21 han sido bien estudiados en el pasado: miR-99a-5p, miR-125b-2-5p, let-7c-5p, miR-155-5p y miR-802-5p, pero se dispone de poca información sobre su expresión en tejidos trisómicos. En este estudio, evaluamos la expresión de estos miARNs en tejidos cardíacos de fetos con SD, mostrando que miR-99a-5p, miR-155-5p y let-7c-5p estaban sobreexpresados en corazones trisómicos. Para investigar su función, se obtuvieron las dianas predichas de diferentes bases de datos y se validaron de forma cruzada utilizando el conjunto de datos de perfiles de expresión génica que habíamos generado previamente para corazones fetales. Ochenta y cinco dianas de let-7c-5p, 33 de miR-155-5p y 10 de miR-99a-5p se expresaban en el corazón fetal y estaban reguladas a la baja en los corazones trisómicos. Dado que los genes mitocondriales codificados nuclearmente estaban regulados a la baja en los corazones trisómicos y que la disfunción mitocondrial es una característica distintiva de los fenotipos del SD, prestamos especial atención a las dianas de let-7c-5p y miR-155-5p reguladas a la baja en los corazones fetales con SD e implicadas en la función mitocondrial. La diana prevista de let-7c-5p SLC25A4/ANT1 se identificó como posible candidata para las anomalías mitocondriales y cardiacas.

El síndrome de inmunodeficiencia adquirida es una grave enfermedad humana causada por el virus de la inmunodeficiencia humana. Se han caracterizado varios genes humanos como factores genéticos del huésped que influyen en los procesos de la enfermedad del SIDA. Estudios recientes sobre pacientes con SIDA revelaron que una serie de enfermedades se complican con el SIDA. Para resolver la interacción de genes entre el SIDA y las enfermedades que complican, se utilizó un análisis de correlación canónica para identificar la correlación global entre el SIDA y la expresión de genes de otras vías de la enfermedad. Los resultados mostraron que HLA-B, HLA-A, MH9, ZNED1, IRF1, TLR8, TSG101, NCOR2, y GML son los genes clave restringidos por el SIDA altamente correlacionados con otros genes de la vía de la enfermedad. Además, los genes de la vía de varias enfermedades como el asma, la enfermedad tiroidea autoinmune y la malaria estaban globalmente correlacionados con los ARG. Esto sugiere que estas enfermedades son de alto riesgo en pacientes con SIDA como enfermedades complicantes.

Miscanthus × giganteus se cultiva ampliamente en todo el mundo como materia prima potencial para biocombustibles; sin embargo, su estrecha base genética y sus características estériles se han convertido en una limitación para su utilización. Como progenitor de M. × giganteus, M. sinensis está ampliamente distribuido por Asia Oriental y presenta una buena tolerancia al estrés abiótico. Para enriquecer las bases de datos y los recursos genómicos de M. sinensis, secuenciamos y anotamos el transcriptoma de M. sinensis utilizando una plataforma Illumina HiSeq 2000. Se generaron aproximadamente 316 millones de lecturas recortadas de alta calidad a partir de 349 millones de lecturas brutas, y se obtuvo un total de 114.747 unigenes tras el ensamblaje de novo. Además, 95.897 (83,57%) unigenes estaban anotados en al menos una base de datos, incluidas NR, Swiss-Prot, KEGG, COG, GO y NT, lo que demuestra que las secuencias obtenidas estaban anotadas correctamente. El análisis de genes expresados diferencialmente indica que los 15 días de estrés por sequía podrían ser un periodo crítico para la respuesta de M. sinensis al estrés por sequía. La secuenciación de alto rendimiento del transcriptoma de M. sinensis bajo estrés por sequía ha enriquecido enormemente los recursos genómicos disponibles en la actualidad. La comparación de los DEGs bajo diferentes periodos de estrés por sequía identificó una gran cantidad de genes candidatos implicados en las redes reguladoras de la tolerancia a la sequía, lo que facilitará la mejora genética y los estudios moleculares de M. sinensis.

La miopatía inducida por fármacos (MID) es un efecto secundario poco frecuente; sin embargo, sus consecuencias pueden ser fatales. Existen pocos informes que evalúen sistemáticamente el mecanismo subyacente de la DIM. En este estudio, hemos elaborado una lista exhaustiva de fármacos DIM basada en productos de etiquetado estructurado (SPL) y hemos llevado a cabo un análisis basado en el espacio de la estructura química, la interacción fármaco-proteína, el espacio de los efectos secundarios y el espacio de los perfiles transcriptómicos. Algunas características clave se enriquecen a partir de cada uno de los análisis. En concreto, la similitud de los fármacos DIM es más significativa que el azar, lo que demuestra que la estructura química podría distinguir los fármacos DIM positivos de los negativos. Se identificó que el citocromo P450 (CYP) era compartido por los fármacos DIM, lo que indicaba el importante papel del metabolismo en el DIM. Tres vías, incluidas las vías del cáncer, la vía de señalización MAPK y la vía de señalización GnRH, enriquecidas a partir del análisis transcriptómico, pueden explicar el mecanismo subyacente del DIM. Aunque el DIM es el objeto actual del estudio, los enfoques propuestos podrían aplicarse a otras evaluaciones de toxicidad y facilitar la evaluación de la seguridad.