La pérdida de sueño o privación de sueño (SD) se refiere a un sueño más corto que la necesidad media de base, y la SD ha sido un grave problema de las sociedades modernas que afecta a la salud y el bienestar. El ginseng Panax es una medicina tradicional china (MTC) muy conocida. Nuestro estudio anterior ha demostrado que los ginsenósidos totales (GS), los extractos de Panax ginseng, podrían mejorar eficazmente la cognición y el comportamiento en ratas con SD. Sin embargo, poco se sabe sobre su estudio metabolómico. En este estudio, se empleó un método metabolómico de suero y cerebro basado en cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (GC/MS) para evaluar la eficacia y estudiar el mecanismo de los GS en un modelo de rata con SD. Con el análisis de reconocimiento de patrones del perfil de metabolitos del suero y el tejido cerebral, se adquirió una clara separación del grupo modelo y el grupo de control para las muestras de suero y tejido cerebral; el grupo MGS (GS modelo) mostró una tendencia a recuperarse en comparación con el grupo de control, lo que concordaba con los parámetros conductuales y bioquímicos. Se identificaron 39 y 40 biomarcadores potenciales de tejidos cerebrales y muestras de suero, respectivamente, y se emplearon para explorar el posible mecanismo. Nuestro trabajo reveló que la GS tiene efectos protectores significativos en la SD, y la metabolómica es una herramienta útil para evaluar la eficacia y elucidar el mecanismo en la MTC.

Lemnaceae (comúnmente llamada lenteja de agua) es una planta acuática ideal para el análisis cuantitativo en ciencias vegetales. Varias especies de esta familia representan las plantas con flores más pequeñas y de crecimiento más rápido. Los distintos ecotipos de una misma especie varían en sus propiedades bioquímicas y fisiológicas. Por ello, es muy importante seleccionar los ecotipos deseables de una especie. Aquí desarrollamos un sistema de identificación molecular sencillo y rápido para Spirodela polyrhiza y Landoltia punctata basado en el polimorfismo de secuencia. En primer lugar, se diseñaron varios pares de cebadores y se seleccionaron tres marcadores como buenos para la identificación. Tras la amplificación por PCR, se detectaron fragmentos de ADN (la combinación de tres productos de PCR) en diferentes lentejas de agua mediante electroforesis capilar. La electroforesis capilar de alta resolución mostró una alta identidad con los resultados de la secuenciación. La combinación de los productos PCR que contenían varios fragmentos de ADN mejoró mucho la frecuencia de identificación. Estos resultados indican que este método no sólo es bueno para la identificación interespecífica, sino también ideal para la distinción intraespecífica. Mientras tanto, se encontraron 11 haplotipos tanto en el ecotipo de S. polyrhiza como en el de L. punctata. Los resultados sugieren que este sistema de marcadores es útil para la identificación a gran escala de la lenteja de agua y para el cribado de ecotipos deseables para mejorar el uso diverso en la utilización de la lenteja de agua.

En la actualidad, las acerías se encuentran en una fase de cambios permanentes marcada por una presión competitiva aún mayor. Por lo tanto, los directivos deben resolver las cuestiones de cómo reducir los costes de producción, cómo superar la competencia y cómo sobrevivir en el mercado mundial. Hay que prestar aún más atención a los métodos de gestión modernos de estudio de mercado y comparación con la competencia. La investigación comparativa es una de las herramientas eficaces para este tipo de investigación. El objetivo de esta contribución es comparar acerías escogidas e indicar nuevas direcciones para su desarrollo con la posibilidad de aumentar la productividad de la producción de acero.INTRODUCCIÓNDesde un punto de vista global, la industria siderúrgica presenta un gran número de productores, la mayoría de los cuales son de tamaño medio. Las diez mayores acerías representan sólo el 25% de toda la producción mundial. Esta fracción de la industria siderúrgica se ha traducido últimamente en un aumento excesivo de las capacidades de producción y en un descenso de los precios del acero. Las organizaciones siderúrgicas se encuentran ahora en una situación en la que el valor de las empresas ha aumentado significativamente gracias a la reducción de los costes de producción. Por lo tanto, los directivos se enfrentan a la cuestión de cómo reducir los costes de producción, cómo superar la competencia y cómo sobrevivir en el mercado mundial. Por lo tanto, es necesario prestar aún más atención a los modernos métodos de gestión de la investigación de mercado y la comparación con la competencia.El benchmarking es una de las herramientas eficaces para la mejora de las empresas, que se orienta a aumentar la eficacia operativa y estratégica que es el contenido real de la actividad de la organización [1]. Este método conduce a la realineación de la cultura de la fi rma hacia el proceso de adquisición de nuevos conocimientos, aumentando el conocimiento laboral, la cualifi cación y la efi cacia.Aunque la evaluación comparativa significa principalmente compararse con los demás a través de un determinado "punto de referencia" estándar, el objetivo no es ser igual a los demás. El objetivo final es más elevado: convertirse en el mejor en un área determinada de la actividad empresarial, lo que significa convertirse en un nuevo punto de referencia. Pero no es posible entrar en tal situación sólo comparando los datos numéricos de los índices de rendimiento y encontrando la respuesta a la pregunta: ¿Cómo? o ¿Cuánto hay que retrasarse? Benchmarking a saber, respuestas a las tres preguntas básicas:- ¿Dónde estamos ahora?

miR-28-5p es un miARN intragénico que está subexpresado en varios tipos de tumores y muestra una actividad supresora tumoral (ST). Habitualmente, las dianas conocidas de miR-28-5p se validan en contextos tumorales específicos, pero no está claro si estas dianas también se regulan en otros tipos de tumores. Con este fin, adoptamos el ensayo de extracción de miARN para capturar las dianas de miR-28-5p en células de cáncer de próstata DU-145 (PCa). En primer lugar, demostramos que miR-28-5p actúa como un TS-miRNA en PCa, afectando a la proliferación celular, la supervivencia y la apoptosis. En segundo lugar, evaluamos el enriquecimiento de las 10 dianas validadas de miR-28-5p en la muestra extraída. Mostramos que E2F6, TEX-261, MAPK1, MPL, N4BP1, y RAP1B pero no BAG1, OTUB1, MAD2L1, y p21 estaban significativamente enriquecidas, sugiriendo que no todas las dianas de miR-28-5p están reguladas por este miARN en el CaP. A continuación, verificamos si las dianas que interactuaban con miR-28-5p estaban reguladas por este miARN. Seleccionamos E2F6, la diana más enriquecida en la muestra extraída, y demostramos que miR-28-5p regulaba a la baja E2F6 a nivel proteico, lo que sugiere que nuestro enfoque fue eficaz. En términos generales, estos resultados apoyan el ensayo de extracción de miARN como un método útil para identificar dianas de miARN en contextos específicos.

Análisis transcriptómicos previos revelaron una firma de 393 transcritos (PTBsig), dominada por genes inducibles por interferón, en sangre total de pacientes con tuberculosis pulmonar (PTB). Las comparaciones con un conjunto limitado de genes inducidos por interferón entre monocitos, linfocitos T CD4, linfocitos T CD8 y neutrófilos separados indicaron que la firma se debe a cambios en los neutrófilos, el tipo celular abrumadoramente predominante. Ampliando el análisis a la totalidad de los 393 transcritos de PTBsig y cambiando las proporciones celulares entre monocitos, linfocitos T CD4, linfocitos T CD8 y neutrófilos separados, creamos PTBsig putativas para sangre completa (pPTBsig) en las que predominaban los linfocitos T CD4 o CD8 o los monocitos o en las que las proporciones celulares no cambiaban. A continuación, estas firmas putativas se comparan con las PTBsig reales notificadas. Demostramos que, debido a su predominio en la sangre periférica y a sus mayores respuestas transcripcionales, los neutrófilos eran de hecho casi exclusivamente responsables de la PTBsig. Advertimos que la importancia funcional de los cambios en otros tipos celulares podría pasar desapercibida en los análisis del transcriptoma basados en sangre total.

Para identificar variantes genéticas que influyan en la densidad mineral ósea (DMO) en la población mexicano-mestiza, realizamos un GWAS para cuello femoral (FN) y columna lumbar (LS) en mujeres posmenopáusicas mexicano-mestizas. En la muestra de descubrimiento, se genotipificaron 300.000 SNP en una cohorte de 411 mujeres posmenopáusicas y se analizaron siete SNP en la cohorte de replicación (n=420). Los resultados combinados de un metaanálisis de las muestras de descubrimiento y replicación identificaron dos loci, RMND1 (rs6904364, P=2,77×10-4) y CCDC170 (rs17081341, P=1,62×10-5), asociados con la FN DMO. También comparamos nuestros resultados con los del metaanálisis del Consorcio de Factores Genéticos para la Osteoporosis (GEFOS). La comparación reveló dos loci de los que se había informado previamente en el metaanálisis del GEFOS: SOX6 (rs7128738) y PKDCC (rs11887431) asociados con FN y LS BMD, respectivamente, en nuestra población de estudio. Curiosamente, el rs17081341 poco frecuente en caucásicos (frecuencia alélica menor < 0,03) se encontró en alta frecuencia en nuestra población, lo que sugiere que esta asociación podría ser específica de poblaciones no caucásicas. En conclusión, el primer estudio piloto mexicano GWA de DMO confirmó loci previamente identificados y también demostró la importancia de estudiar la variabilidad en poblaciones diversas y/o poblaciones específicas.

Los microARN (miARN) son una clase de pequeños ARN no codificantes que actúan principalmente como reguladores negativos de la expresión génica. Varios estudios han demostrado que los miARN intervienen en numerosos procesos biológicos, como la proliferación, la apoptosis y la migración. La desregulación de los miARN se ha observado con frecuencia en diferentes tipos de enfermedades, incluido el cáncer. En este trabajo se ofrece una revisión exhaustiva del miR-193a-3p humano, considerando su papel tanto en contextos fisiológicos como patológicos. Se han descrito diferentes mecanismos implicados en la regulación de la expresión de miR-193a-3p, incluyendo modificaciones epigenéticas y factores de transcripción. En contextos fisiológicos, miR-193a-3p parecía capaz de limitar la proliferación y la progresión del ciclo celular en células normales. Notablemente, varias publicaciones demostraron que miR-193a-3p actuaba como un miRNA supresor de tumores en el cáncer dirigiéndose a diferentes genes implicados en la proliferación, apoptosis, migración, invasión y metástasis. Además, se ha observado la regulación a la baja de miR-193a-3p en muchos tumores primarios y se han identificado niveles alterados de miR-193a-3p circulante en suero o plasma de pacientes con cáncer y de sujetos afectados por la enfermedad de Parkinson o por esquizofrenia. Desde una perspectiva clínica, se necesitan más estudios para explorar los efectos antitumorales de la administración de imitadores de miR-193a-3p y la relevancia de la detección de este miARN como posible biomarcador diagnóstico y pronóstico.

Los roedores Akodontini sudamericanos se caracterizan por un gran número de reordenamientos cromosómicos. Entre ellos, el género Akodon ha sido ampliamente analizado con citogenética clásica y molecular, lo que permitió identificar un gran número de variaciones cromosómicas intra e interespecíficas debidas a reordenamientos Robertsonianos, inversiones pericéntricas y adiciones/deleciones de heterocromatina. Con el fin de arrojar algo de luz sobre la causa de estos reordenamientos, analizamos comparativamente los cariotipos de tres especies de Akodontini, Akodon cursor (2n = 14, FN = 19), A. montensis (2n = 24, FN = 42) y Necromys lasiurus (2n = 34, FN = 34), tras la técnica de bandas GTG y CBG. Los cariotipos se diferenciaban por reordenamientos robertsonianos, inversiones pericéntricas, reposicionamiento del centrómero y variación de la heterocromatina. Las comparaciones genómicas se realizaron mediante hibridación fluorescente in situ interespecífica (FISH) con ADN genómico total de cada especie como sondas (GISH). Nuestros resultados revelaron una conservación considerable de las porciones eucromáticas entre los tres cariotipos, lo que sugiere que difieren principalmente en sus regiones heterocromáticas. También se realizó FISH para evaluar la distribución de secuencias teloméricas, elementos repetitivos intercalados largos y cortos (LINE-1 y B1 SINE) y del retrovirus endógeno mysTR en los genomas de las tres especies. Los resultados nos llevaron a inferir que los elementos transponibles han desempeñado un papel importante en la enorme variación cromosómica encontrada en Akodontini.

Antecedentes. El rápido avance de las tecnologías de secuenciación ha hecho posible la producción regular de millones de lecturas de alta calidad a partir de las muestras de ADN en los laboratorios de secuenciación. Con este fin, el grafo de Bruijn es una estructura de datos muy popular en la literatura sobre ensamblaje de genomas para representar y procesar datos de forma eficiente. Debido al número de nodos de un grafo de Bruijn, el principal obstáculo es la memoria y el tiempo de ejecución. Por lo tanto, esta área ha recibido una atención significativa en la literatura contemporánea. Resultados. En este artículo, presentamos un enfoque llamado HaVec que intenta lograr un equilibrio entre el consumo de memoria y el tiempo de ejecución. HaVec utiliza una tabla hash junto con una estructura de datos vectorial auxiliar para almacenar el grafo de Bruijn, mejorando así el uso total de memoria y el tiempo de ejecución. Una característica crítica y digna de mención de HaVec es que no presenta errores de falsos positivos. Conclusiones. En general, el procedimiento de construcción de grafos ocupa la mayor parte del tiempo de un proceso de ensamblaje. HaVec puede considerarse un avance significativo en este aspecto. Prevemos que HaVec será extremadamente útil en el ensamblaje de genomas basado en grafos de Bruijn.

Se llevó a cabo un estudio de asociación de genoma completo (GWAS) para examinar los loci de rasgos cuantitativos de expresión (eQTLs) para los genes de histonas. Se examinaron los eQTL comunes para múltiples genes de histonas en 373 líneas celulares linfoblastoides europeas (LCL). Se empleó un modelo de regresión lineal para identificar polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) asociados con la expresión de los genes histónicos, y el número de eQTLs se determinó mediante un análisis de desequilibrio de ligamiento. También se examinaron las asociaciones adicionales de los eQTLs identificados con otros genes. Identificamos 31 eQTLs para 29 genes de histonas a través de un análisis de genoma completo utilizando 29 genes de histonas (P<2.97×10-10). Entre ellos, 12 eQTLs se asociaron con la expresión de múltiples genes de histonas. El análisis de asociación de todo el transcriptoma utilizando los eQTLs identificados mostró sus asociaciones con 80 genes adicionales (P<4,75×10-6). En particular, la expresión de los genes RPPH1, SCARNA2 y SCARNA7 se asoció con 26, 25 y 23 eQTLs, respectivamente. Este estudio sugiere que los genes de histonas compartieron 12 eQTLs comunes que podrían regular la transcripción dependiente del ciclo celular de los genes de histonas y otros genes. Se necesitan más investigaciones para dilucidar los mecanismos transcripcionales de estos genes.