Saltar navegación e ir al contenido principal

Estás filtrando por

Se encontraron 110737 resultados en recursos

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

Wenxin Granule (WXKL) es una medicina tradicional china utilizada para el tratamiento del infarto de miocardio (IM) y las arritmias. Sin embargo, se desconocen en gran medida los mecanismos genómicos patológicos del IM y los mecanismos del WXKL. El objetivo de este estudio es investigar un perfil completo de expresión de miARN y las vías de correlación predichas a las que se dirigen los miARN expresados de forma diferencial en el IM, así como los mecanismos de la WXKL desde el punto de vista génico. Se realizaron microarrays de expresión de miARN y los datos se depositaron en Gene Expression Omnibus (número GEO GSE95855). Además, se realizó un análisis de vías utilizando la herramienta en línea DIANA-miRPath v3.0. Las expresiones de miR-1, miR-133, Cx43 y Cx45 se detectaron mediante PCR cuantitativa en tiempo real. Se descubrió que 35 miRNAs expresados diferencialmente y 23 vías predichas, incluyendo miR-1, miR-133, y la vía de unión gap, están implicadas en la patogénesis del IM. Y, WXKL aumentó las expresiones de miR-1 y miR-133, mientras que también aumentó los niveles de ARNm de Cx43 y Cx45, y, sobre todo, recuperó la relación Cx43/Cx45 cerca del nivel normal. Los resultados sugieren que los efectos reguladores sobre miR-1, miR-133, Cx43 y Cx45 podrían ser un posible mecanismo de WXKL en el tratamiento del IM a nivel génico.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

Los ARN no codificantes largos (lncARN) y los microARN (miARN) desempeñan un papel importante en el desarrollo del cáncer como reguladores de los genes que codifican proteínas. Su desregulación ya se asociaba en cierta medida al glioma, el tumor cerebral primario más agresivo en adultos. Debido a la elevada heterogeneidad tumoral, el diagnóstico correcto y la selección del tratamiento pueden resultar difíciles e inadecuados, lo que se traduce en un mal pronóstico. El estudio de los patrones de expresión de los ARN no codificantes (ARNnc) podría proporcionar información útil sobre el desarrollo molecular del glioma. Se utilizó el método qPCR para investigar la expresión de lncRNAs previamente desregulados en otros tipos de cáncer. El estudio mostró niveles de expresión alterados para numerosos lncRNAs en muestras de glioma histológicamente diferentes. La validación de unos pocos lncRNAs mostró una asociación de los niveles de expresión con el subtipo histológico y/o el grado de malignidad. También observamos una expresión desregulada y diferenciada por subtipos para cuatro miARNs asociados a lncARNs. La expresión de unos pocos lncRNAs y miRNAs también se asoció con la supervivencia de las pacientes, mostrando un potencial valor pronóstico. Varios ncRNAs, algunos ya relacionados con el glioma y otros, hasta donde sabemos, investigados por primera vez, podrían ser de mayor importancia en el desarrollo molecular y la progresión del glioma. Encontrar los patrones de expresión de lncARN y/o miARN específicos de cada subtipo puede aportar información adicional para una clasificación más objetiva.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

Antecedentes. Existen muchas firmas de expresión génica para describir el estado biológico de tumores perfilados. El Análisis de Componentes Principales (ACP) puede utilizarse para resumir una firma génica en una única puntuación. Nuestra hipótesis es que las firmas génicas pueden ser validadas cuando se aplican a nuevos conjuntos de datos, utilizando propiedades inherentes del PCA. Resultados. Esta validación se basa en cuatro conceptos clave. Coherencia: los elementos de una firma genética deben estar correlacionados más allá del azar. Unicidad: la dirección general de los datos examinados puede conducir a la mayor parte de la señal observada. Robustez: si una firma génica está diseñada para medir un único efecto biológico, entonces esta señal debe ser lo suficientemente fuerte y distinta en comparación con otras señales dentro de la firma. Transferibilidad: la puntuación de la firma génica PCA derivada debería describir la misma biología en el conjunto de datos objetivo que en el conjunto de datos de entrenamiento. Conclusiones. El procedimiento de validación propuesto garantiza que las firmas génicas basadas en PCA funcionen como se espera cuando se aplican a conjuntos de datos distintos de aquellos en los que se entrenaron las firmas. Las firmas complejas, que describen múltiples componentes biológicos independientes, también se identifican fácilmente.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2016

Las histonas desacetilasas (HDAC) son importantes reguladores de la transcripción génica, por lo que controlan múltiples procesos celulares. A pesar de su papel esencial en plantas, HDA6 aún no se ha validado en judía común. En este estudio, demostramos que HDA6 está implicada en el desarrollo de la planta y en la respuesta al estrés. Se determinó la expresión diferencial de HDA6 en varios tejidos y se observó que la expresión aumentaba con la edad de la planta (plántula < floración < madurez). Se observó una mayor expresión en flores y vainas que en tallo, hoja y raíz. La regulación al alza del gen HDA6 durante el estrés por frío implica su papel destacado en el estrés abiótico. Además, se aisló el gen HDA6 de tres genotipos de judía común y los análisis de secuencia revelaron homología con homólogos funcionalmente caracterizados en especies modelo. El producto traducido de 53 kDa se detectó utilizando un anticuerpo específico HDA6 y la proteína recombinante sobreexpresada en Escherichia coli mostró actividad HDAC in vitro. Hasta donde sabemos, éste es el primer informe sobre la judía común, un cultivo de importancia agrícola, en el que se describe la caracterización funcional y el papel biológico de HDA6.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

Se utilizó un ensayo del transcriptoma genómico de dos genotipos subtropicales de maíz para observar la expresión de genes en la fase de plántula sometida a estrés por sequía. El número de genes expresados diferencialmente fue mayor en HKI1532 (un genotipo tolerante a la sequía) que en PC3 (un genotipo sensible a la sequía), lo que indica diferencias primarias a nivel transcripcional en la tolerancia al estrés. Las redes globales de coexpresión de los dos genotipos diferían significativamente en cuanto al número de módulos y al patrón de coexpresión dentro de los módulos. Se seleccionó un total de 174 genes sensibles a la sequía de HKI1532, y su red de coexpresión reveló correlaciones clave entre diferentes vías adaptativas, representando cada grupo de la red una función biológica específica. Los factores de transcripción relacionados con el cierre estomático dependiente de ABA, la señalización y las cascadas de fosfoproteínas trabajan de forma concertada para compensar la reducción de la fotosíntesis. Bajo estrés, el equilibrio hídrico se mantuvo mediante la coexpresión de los genes implicados en los ajustes osmóticos y las proteínas transportadoras. El metabolismo se mantuvo mediante la coexpresión de genes implicados en la modificación de la pared celular y el metabolismo de proteínas y lípidos. Se identificó la interacción de genes implicados en funciones biológicas cruciales durante el estrés y los resultados serán útiles para localizar interacciones génicas importantes para comprender con mayor detalle la tolerancia a la sequía.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

La osteoartritis (OA) es el trastorno articular relacionado con la edad más frecuente en el ser humano. Los microARN (miARN), una clase de pequeños ARN no codificantes, son posibles dianas terapéuticas para regular mecanismos moleculares tanto en la enfermedad como en el envejecimiento. Aunque cada vez se investigan más las funciones de los miARN en el envejecimiento, apenas se han estudiado los cambios de los miARN relacionados con la edad en el cartílago. Hemos llevado a cabo un estudio de microarrays en cartílagos humanos jóvenes y viejos. Los resultados se validaron en una cohorte independiente. Los contrastes entre estas muestras identificaron veinte miARN expresados diferencialmente en un cartílago de donantes ancianos, derivados de un entorno de OA que se agruparon en función de la gravedad de la OA. Identificamos una serie de miRNAs reconocidos y novedosos que cambian en el envejecimiento del cartílago y la OA, incluyendo miR-126: un nuevo candidato potencial con un papel en la patogénesis de la OA. Estos análisis representan importantes candidatos con potencial como biomarcadores y dianas terapéuticas del envejecimiento del cartílago y la OA.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

Diversas proteínas reguladoras desempeñan un papel fundamental en la gestión del crecimiento saludable de las plantas en condiciones de estrés. Para explorar los transcritos que responden al estrés osmótico se utilizó la PCR de transcriptasa inversa de visualización diferencial y la amplificación aleatoria de extremos de ADNc (RACE). Se identificó y caracterizó el factor de transcripción RMYB sensible al estrés salino tipo R2R3 de Hibiscus sabdariffa, que tiene un marco de lectura abierto de 690 pb y codifica 229 aminoácidos de cadena larga. El análisis in silico confirmó los dominios R2 y R3 conservados, así como un sitio de localización NLS-1. Los aminoácidos deducidos de RMYB compartían 83, 81, 80, 79, 72, 71 y 66% de homología con Arabidopsis thaliana, Glycine max, Oryza sativa, Zea maize, Malus domestica, Populus tremula × Populus alba y la familia MYB específica de Medicago sativa, respectivamente. Observamos la regulación al alza del gen en el tejido del tallo, la hoja y la raíz en respuesta al estrés abiótico. Además, el gen RMYB se clonó en un vector de expresión vegetal bajo el promotor CaMV35S y se transformó en Gossypium hirsutum: un cultivar local de algodón. Se observó la sobreexpresión de RMYB en plantas transgénicas sometidas a estrés abiótico, lo que sugiere además su función reguladora en respuesta a condiciones de estrés. La sobreexpresión del factor de transcripción RMYB en plantas transgénicas de algodón puede utilizarse como agente potencial para el desarrollo de cultivares tolerantes al estrés.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

La leucemia mieloide aguda (LMA) es una neoplasia hematológica maligna caracterizada por la proliferación excesiva de células mieloides inmaduras junto con un deterioro de la diferenciación. Se han descrito muchos casos de LMA sin anomalías citogenéticas conocidas y sin mutaciones en genes impulsores asociados a la LMA. En este estudio, se seleccionaron 200 casos de LMA de una cohorte públicamente disponible y se analizaron diferencialmente en busca de anomalías genéticas, epigenéticas y citogenéticas. Tres genes (FLT3, DNMT3A, y NPMc) se encuentran predominantemente mutados. Identificamos varias aberraciones asociadas con cambios de metilación en todo el genoma. Entre ellas se incluyen las mutaciones Del (5q), T (15; 17) y NPMc. Cuatro aberraciones -Del (5q), T (15; 17), T (9; 22) y T (9; 11)- se asocian significativamente con la supervivencia de los pacientes. Los pacientes positivos para Del (5q) tienen una supervivencia media inferior a 1 año, mientras que los pacientes positivos para T (15; 17) tienen un pronóstico significativamente mejor. La combinación de los datos de metilación y mutación revela tres grupos distintos de pacientes y cuatro grupos de genes. Especulamos que las firmas combinadas tienen el mejor potencial para ser utilizadas para la subclasificación de la LMA, complementando las firmas citogenéticas. Se requiere una cohorte de muestras más amplia y una mayor investigación de los efectos observados en este estudio para permitir la aplicación clínica de nuestra clasificación de pacientes asistida por la metilación del ADN.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2016

Son muchos los factores medioambientales y biológicos que influyen en las prácticas forestales. El aspecto de las laderas es uno de los factores ambientales más importantes en estas prácticas debido a su fácil aplicación para los gestores. La variación de la fertilidad definida como la capacidad de un individuo para dar progenie y la diversidad genética estimada en base al número efectivo de progenitores fueron investigadas como la proporción del número de conos contados de individuos en rodales naturales muestreados aspectualmente de cedro de Taurus (Cedrus libani A. Rich.) durante tres años consecutivos. Las medias del número de conos fueron 19,4, 47,2 y 75,5 para los años. Fue el más alto en llano (23,5) para 2013, en sur (92,1) para 2014 y en llano (95,7) para 2015, mientras que fue el más bajo en sur (16,3), en este (18,2) y en norte (39,4) para los años, respectivamente. Se estimaron correlaciones significativas (p?0,01) entre años para la producción de conos en el aspecto polled. Las variaciones de fertilidad estimadas cambiaron para los años y los rodales. En general, podría ser un nivel aceptable para los rodales naturales típicos, excepto en el oeste de 2014. Las variaciones de fertilidad fueron de 1,55, 3,05 y 1,64 en los rodales de polinización para los distintos años. La diversidad genética fue de 0,99 para los años en los rodales polled. El aspecto norte podría tenerse en cuenta en el establecimiento y la selección de fuentes de semillas y áreas de conservación de genes en función de la variación de la fertilidad y la diversidad genética.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi | Fecha: 2017

Los elementos repetitivos transponibles, denominados "TREoma", representan aproximadamente el 40% del genoma del ratón. Postulamos que el genoma de la línea germinal experimenta una diversificación temporal y espacial en genomas somáticos en conjunción con la actividad TREome. Los ratones consanguíneos C57BL/6J fueron sometidos a análisis del paisaje genómico utilizando una sonda TREome de retrovirus endógenos del tipo del virus de la leucemia murina (MLV-ERVs). Ninguno compartía el mismo paisaje MLV-ERV dentro de cada grupo de comparación: (1) esperma y 18 tejidos de un ratón, (2) seis compartimentos cerebrales de dos hembras, (3) muestras de bazo y timo de cuatro grupos de edad, (4) tres conjuntos de tejidos espaciales de dos hembras, y (5) muestras de riñón e hígado de tres hembras y tres machos. Curiosamente, los machos tenían más copias genómicas MLV-ERV que las hembras; además, sólo en los machos, los riñones tenían más copias MLV-ERV que los hígados. Tal vez, los paisajes MLV-ERV dependientes del ratón, el sexo y el tejido/la célula estén relacionados con los fenotipos específicos individuales y dinámicos de la población endogámica C57BL/6J.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros