Saltar navegación e ir al contenido principal

Estás filtrando por

Se encontraron 110737 resultados en recursos

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Se obtuvo una población de 146 RIL (Recombinant Inbred Line) a partir del cruce entre una Solanum lycopersicum L. XF98-7 cultivada sensible al frío y una Solanum pimpinellifolium LA2184 silvestre tolerante al frío. Para evaluar la tolerancia al frío de las líneas parentales y las RIL se utilizaron el índice de germinación relativa (RGR) y el índice de enfriamiento (CI). Se encontró que el RGR y el IC fueron significativamente diferentes entre S. lycopersicum XF98-7 y S. pimpinellifolium LA2184 bajo tratamiento de frío, indicando que las especies silvestres estaban más adaptadas a la temperatura de enfriamiento. La distribución continua y normal de RGR y CI en la población RIL sugirió que el rasgo de tolerancia al frío era un rasgo típicamente cuantitativo controlado por multigenes. El mapa de ligamiento molecular se construyó utilizando 120 marcadores de repetición de secuencia simple (SSR), dando lugar a 15 grupos de ligamiento, con una distancia total de 256,8 cM y un intervalo medio de 2,14 cM. Se detectaron cinco QTL que controlan la RGR y cuatro QTL para el IC, con una contribución genética que osciló entre el 0,95% y el 19,55%. Por lo tanto, los nueve QTLs proporcionarán referencias para futuros mapeos de posición fina para la tolerancia al frío. Los marcadores polimórficos podrían utilizarse para seleccionar indirectamente el rasgo vegetal de interés y promover el desarrollo de nuevas variedades de tomate mediante selección asistida por marcadores.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

En la era reciente, debido al enorme avance de la industrialización, la contaminación y otras actividades antropogénicas han creado un grave escenario para la supervivencia de la biota. Se ha informado de que la biota actual está entrando en una "sexta" extinción masiva, debido a la exposición crónica a las actividades antropogénicas. Se han adoptado diversas medidas ex situ e in situ para la conservación de las especies animales y vegetales amenazadas y en peligro de extinción; sin embargo, éstas han sido limitadas debido a diversas discrepancias asociadas a ellas. Los avances actuales en tecnologías moleculares, especialmente la genómica, están desempeñando un papel crucial en la conservación de la biodiversidad. La genómica avanzada ayuda a identificar los segmentos del genoma responsables de la adaptación. También puede mejorar nuestra comprensión de la microevolución mediante una mejor comprensión de la selección, la mutación, el apareamiento asertivo y la recombinación. La genómica avanzada ayuda a identificar genes esenciales para la aptitud y, en última instancia, a desarrollar herramientas modernas y rápidas de seguimiento de la biodiversidad amenazada. Este artículo de revisión se centra en las aplicaciones de la genómica avanzada, principalmente demográfica, variaciones genéticas adaptativas, endogamia, hibridación e introgresión, y susceptibilidades a enfermedades, en la conservación de la biota amenazada. En resumen, proporciona los fundamentos para los lectores noveles y los avances en genómica para los expertos que trabajan en la conservación de especies vegetales y animales amenazadas.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Para dos bibliotecas (PDF1 y ODF1) se utilizó la secuenciación Illumina y se obtuvieron 44.082.301 y 43.708.132 lecturas limpias, respectivamente. Tras ser mapeados en la base de datos RefSeq bovina, se identificaron 15.533 genes expresados en ambos tipos de folículos (corte RPKM > 0,5), de los cuales 719 estaban altamente expresados en los folículos bovinos (corte RPKM > 100). Además, se identificaron 83 genes con expresión diferencial en ODF1 frente a PDF1, de los cuales 42 genes estaban regulados al alza y 41 a la baja. El análisis de vías KEGG reveló dos genes regulados al alza en ODF1 frente a PDF1, CYP11A1 y CYP19A1, que son genes importantes en la vía de biosíntesis de hormonas esteroides. Este estudio representa la primera investigación del transcriptoma de los folículos bovinos en las fases de predesviación e inicio de la desviación y proporciona una base para futuras investigaciones de los mecanismos reguladores implicados en el desarrollo folicular en bovinos.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

El parental fundador suele desempeñar un papel importante en la mejora genética del trigo. Ningmai 9 es una variedad de trigo blando con buen rendimiento, calidad y resistencia a las enfermedades del trigo. Por lo tanto, sirve como una importante variedad comercial y padre fundador en la parte media y baja del río Yangtze en China. Hasta la fecha, se han desarrollado 20 nuevos cultivares a partir de Ningmai 9 y se han liberado para la producción de trigo en los últimos 10 años. En este estudio, se utilizó el chip 90K iSELECT ILLUMINA para analizar el genotipo de Ningmai 9 y sus 17 derivados. Los coeficientes de similitud genética entre Ningmai 9 y sus derivados fueron superiores a 0,7, excepto en el caso de Yangfumai 4. El análisis Neighbor-Joining mostró que Yangfumai 4 tenía la mayor distancia genética de Ningmai 9 en todos los derivados. Había una gran diferencia para la misma proporción alélica en derivados o cromosomas, aunque los valores medios de la misma proporción alélica en los genomas A, B y D eran cercanos entre sí. La diferencia fenotípica en Ningmai 9, Ningmai 13 y Yangfumai 4 fue coherente con su diferencia en el fondo genético mediante la comparación de QTLs previamente reportados. Se encontraron algunas regiones cromosómicas calientes que podrían utilizarse para la selección asistida por marcadores en la mejora genética del trigo.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Dentro de una especie de planta leñosa, la heterogeneidad ambiental tiene el potencial de influir en la distribución de la variación genética entre poblaciones a través de varios procesos evolutivos. En algunas especies puede detectarse una relación entre las características ambientales y la distribución de los genotipos, lo que demuestra la importancia de la selección natural como principal fuente de diferenciación. Nothofagus dombeyi (Mirb.) Oerst. (Nothofagaceae) es una especie arbórea endémica de los bosques templados de Chile y Argentina. La historia postglacial se ha estudiado con ADN de cloroplastos y las fuerzas evolutivas que determinan los patrones de variación genética se han analizado con isozimas, pero se necesitan estudios de diversidad genética a escala fina. El estudio de las historias demográficas y de selección en Nothofagus dombeyi requiere marcadores más informativos, como los polimorfismos de nucleótido único (SNP). Las herramientas de genotipado por secuenciación permiten ahora estudiar miles de marcadores SNP a precios razonables en especies no modelo. Hemos investigado más de 10.000 loci SNP en busca de señales de adaptación local y hemos demostrado que la interrogación de los recursos genómicos puede identificar cambios en la diversidad genética y señales adaptativas putativas en esta especie leñosa no modelo.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2015

Vespa mandarinia, presente en los bosques de Asia Oriental, incluida Corea, ocupa el rango más alto en la red trófica de artrópodos dentro de su área de distribución geográfica. Sirve como fuente de nutrición en forma de mezcla de aminoácidos de Vespa y está catalogada como especie amenazada, aunque no se han aplicado medidas de conservación. En este trabajo hemos realizado el ensamblaje de novo del transcriptoma de V. mandarinia mediante secuenciación Illumina HiSeq 4000. Se obtuvieron más de 60 millones de lecturas brutas y 59.184.811 lecturas limpias. Tras el ensamblaje, se agruparon un total de 66.837 unigenes, de los cuales 40.887, 44.455 y 22.390 mostraron coincidencias homólogas con las bases de datos PANM, Unigene y KOG, respectivamente. Se asignó un total de 15.675 unigenes a términos de la Ontología Genética y 5.132 unigenes a 115 vías KEGG. El dominio de dedo de zinc (similar a C2H2), el dominio de serina/treonina/proteína quinasa de doble especificidad y el dominio de motivo de reconocimiento de ARN se encontraban entre los principales dominios de InterProScan predichos para las secuencias de V. mandarinia. Entre los unigenes, identificamos 534.922 repeticiones de secuencias simples de ADNc como marcadores potenciales. Este es el primer análisis transcriptómico de la avispa V. mandarinia utilizando Illumina HiSeq 4000. Los conjuntos de datos obtenidos deberían promover la búsqueda de nuevos genes para comprender los atributos fisiológicos de esta avispa.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Mediante un análisis comparativo de proteómica cuantitativa shotgun en Brassica rapa (línea endogámica Chiifu), se identificaron un total de 3.009 proteínas no redundantes con una tasa de falsos descubrimientos de 0,01 en plantas de 3 semanas sometidas a tratamiento de deshidratación durante 0, 24 y 48 h, y plantas sometidas a estrés por sequía. Las carboxilasas de ribulosa-bisfosfato, la proteína de unión a la clorofila a/b y el complejo de recolección de luz en el fotosistema II fueron proteínas muy abundantes en las hojas y representaron el 9%, 2% y 4%, respectivamente, del total de proteínas identificadas. El análisis comparativo de los tratamientos permitió detectar 440 proteínas expresadas diferencialmente durante la deshidratación. Los resultados del análisis de agrupamiento, el análisis de enriquecimiento de la ontología génica (GO) y el análisis de perfiles de expresión compuestos de categorías funcionales para las proteínas expresadas diferencialmente indicaron que el estrés por sequía redujo los niveles de proteínas asociadas a la fotosíntesis y aumentó los niveles de proteínas implicadas en procesos catabólicos y respuestas al estrés. Se observó una mayor expresión de muchas proteínas implicadas en las respuestas al estrés osmótico y de proteínas con actividad antioxidante. Basándonos en funciones moleculares previamente descritas, proponemos que las siguientes cinco proteínas expresadas diferencialmente podrían proporcionar genes diana para la ingeniería de la resistencia a la sequía en plantas: anexina, fosfolipasa D delta, regulador transcripcional de unión a sADN, proteína de la familia GH3 sensible a auxina y proteína de la familia TRAF-like.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La regulación epigenética desempeña importantes funciones biológicas en las plantas, como el momento de la floración y el desarrollo del endospermo. Se sabe poco sobre los mecanismos que controlan la heterocronía (el cambio en el momento o el ritmo de los eventos de desarrollo durante la ontogenia) en Eucalyptus globulus. La metilación del ADN se ha propuesto como un potencial mecanismo regulador de la heterocronía en especies modelo, pero su papel durante la fase vegetativa en E. globulus no ha sido explorado. Para investigar los mecanismos moleculares que gobiernan la heterocronía en E. globulus, hemos desarrollado un flujo de trabajo dirigido a generar mapas de hipermetiloma e hipometiloma de alta resolución que han sido analizados en dos etapas de la fase de crecimiento vegetativo: juvenil (hojas de 6 meses) y adulta (hojas de 30 meses). Se utilizó el método M

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La reciente ventaja obtenida por la secuenciación de nueva generación permite investigar en profundidad un nuevo "viejo" tipo de transcrito no codificante, los ARN circulares. Los ARN circulares son ARN no traducidos, típicamente no poliadenilados, con una resistencia a las exonucleasas que les confiere la capacidad de ser más estables que las isoformas comunes de ARN lineal. Utilizamos una herramienta de detección bioinformática (CIRCexplorer) para investigar los circARN predictivos a partir de los datos secuenciados de nueva generación de cinco muestras de carcinoma ductal in situ (CDIS) y carcinoma ductal invasivo (CDI) adyacente emparejado. Además, también investigamos los ARN circulares expresados en MCF7, una línea celular de carcinoma ductal de mama invasivo. Describimos el contexto genómico de los ARN circulares predichos y abordamos los posibles papeles funcionales hipotéticos. Este estudio mostró una perspectiva de un panel de circRNAs predictivos identificados y la función que podrían ejercer los circRNAs.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Los aislados de Pasteurella multocida capsular tipo A pueden causar neumonía y enfermedad respiratoria bovina (ERB). En este estudio, se llevó a cabo un análisis genómico comparativo para identificar los genes de virulencia en dos aislados virulentos diferentes de P. multocida capsular tipo A (PmCQ2 de alta virulencia y PmCQ6 de baja virulencia). El borrador de la secuencia genómica de PmCQ2 es de 2,32 Mbp y contiene 2.002 genes codificadores de proteínas, 9 elementos de secuencia de inserción (IS) y 1 región profágica. El borrador de la secuencia genómica de PmCQ6 es de 2,29 Mbp y contiene 1.970 genes codificadores de proteínas, 2 elementos IS y 3 regiones profágicas. El análisis de alineación del genoma reveló que la similitud genómica entre PmCQ2 y PmCQ6 es del 99% con una alta colinealidad. Para identificar los genes candidatos responsables de la virulencia, se compararon PmCQ2 y PmCQ6 con los genomas publicados de Pm36950 y PmHN06, altamente virulentos, y Pm3480 y Pm70 (capsular tipo F), avirulentos. Se identifican cinco genes y dos secuencias de inserción en las cepas de alta virulencia, pero no en las de baja virulencia ni en las avirulentas. Estos resultados indican que estos genes o secuencias de inserción podrían ser responsables de la virulencia de P. multocida, proporcionando posibles candidatos para futuros estudios sobre la patogénesis y las interacciones hospedador-patógeno de P. multocida.

Fuente: Revista Virtual Pro Formatos de contenido: Otros