Genome-Wide Identification and Characterization of the ALOG Domain Genes in Rice
Los genes de dominio ALOG, que toman su nombre de las proteínas LSH1 de Arabidopsis y G1 de Oryza (ALOG), se han señalado con frecuencia como reguladores clave del desarrollo en arroz y Arabidopsis. Sin embargo, la investigación de la familia de genes ALOG es limitada. En este trabajo se ha llevado a cabo una investigación del genoma completo de la familia de genes ALOG en arroz y otras seis especies. En total, se identificaron ochenta y cuatro genes de dominio ALOG en las siete especies, de los cuales catorce genes de dominio ALOG (OsG1/G1Ls) se identificaron en el genoma del arroz. Los catorce OsG1/G1L estaban distribuidos de forma desigual en ocho cromosomas, y descubrimos que ocho duplicaciones segmentarias contribuyeron a la expansión de los OsG1/G1L en el genoma del arroz. Los ochenta y cuatro genes de la familia ALOG de siete especies se clasificaron en seis grupos, y los motivos 1, 2 y 3 definidos por el dominio ALOG se conservaron en gran medida en todas las especies según el análisis filogenético y estructural. Sin embargo, los motivos 4 y 5 recientemente identificados sólo estaban presentes en monocotiledóneas, lo que indica una función específica en monocotiledóneas. Además, las OsG1/G1L mostraban patrones de expresión específicos para cada tejido. El análisis de coexpresión sugirió que OsG1 integra OsMADS50 y los genes MADS-box posteriores, como OsMADS1, para regular el desarrollo de la inflorescencia del arroz; OsG1L7 se asocia potencialmente con OsMADS22 y OsMADS55 para regular la elongación del tallo. Además, el análisis comparativo de expresión reveló las funciones biológicas conservadas de los genes de la familia ALOG entre el arroz, el maíz y Arabidopsis. Estos resultados han arrojado luz sobre el estudio funcional de los genes de la familia ALOG en arroz y otras plantas.
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Revista Virtual Pro
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