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Se encontraron 110737 resultados en recursos

Exclusivo BibloRed

Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La regulación epigenética desempeña importantes funciones biológicas en las plantas, como el momento de la floración y el desarrollo del endospermo. Se sabe poco sobre los mecanismos que controlan la heterocronía (el cambio en el momento o el ritmo de los eventos de desarrollo durante la ontogenia) en Eucalyptus globulus. La metilación del ADN se ha propuesto como un potencial mecanismo regulador de la heterocronía en especies modelo, pero su papel durante la fase vegetativa en E. globulus no ha sido explorado. Para investigar los mecanismos moleculares que gobiernan la heterocronía en E. globulus, hemos desarrollado un flujo de trabajo dirigido a generar mapas de hipermetiloma e hipometiloma de alta resolución que han sido analizados en dos etapas de la fase de crecimiento vegetativo: juvenil (hojas de 6 meses) y adulta (hojas de 30 meses). Se utilizó el método M

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La reciente ventaja obtenida por la secuenciación de nueva generación permite investigar en profundidad un nuevo "viejo" tipo de transcrito no codificante, los ARN circulares. Los ARN circulares son ARN no traducidos, típicamente no poliadenilados, con una resistencia a las exonucleasas que les confiere la capacidad de ser más estables que las isoformas comunes de ARN lineal. Utilizamos una herramienta de detección bioinformática (CIRCexplorer) para investigar los circARN predictivos a partir de los datos secuenciados de nueva generación de cinco muestras de carcinoma ductal in situ (CDIS) y carcinoma ductal invasivo (CDI) adyacente emparejado. Además, también investigamos los ARN circulares expresados en MCF7, una línea celular de carcinoma ductal de mama invasivo. Describimos el contexto genómico de los ARN circulares predichos y abordamos los posibles papeles funcionales hipotéticos. Este estudio mostró una perspectiva de un panel de circRNAs predictivos identificados y la función que podrían ejercer los circRNAs.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Los aislados de Pasteurella multocida capsular tipo A pueden causar neumonía y enfermedad respiratoria bovina (ERB). En este estudio, se llevó a cabo un análisis genómico comparativo para identificar los genes de virulencia en dos aislados virulentos diferentes de P. multocida capsular tipo A (PmCQ2 de alta virulencia y PmCQ6 de baja virulencia). El borrador de la secuencia genómica de PmCQ2 es de 2,32 Mbp y contiene 2.002 genes codificadores de proteínas, 9 elementos de secuencia de inserción (IS) y 1 región profágica. El borrador de la secuencia genómica de PmCQ6 es de 2,29 Mbp y contiene 1.970 genes codificadores de proteínas, 2 elementos IS y 3 regiones profágicas. El análisis de alineación del genoma reveló que la similitud genómica entre PmCQ2 y PmCQ6 es del 99% con una alta colinealidad. Para identificar los genes candidatos responsables de la virulencia, se compararon PmCQ2 y PmCQ6 con los genomas publicados de Pm36950 y PmHN06, altamente virulentos, y Pm3480 y Pm70 (capsular tipo F), avirulentos. Se identifican cinco genes y dos secuencias de inserción en las cepas de alta virulencia, pero no en las de baja virulencia ni en las avirulentas. Estos resultados indican que estos genes o secuencias de inserción podrían ser responsables de la virulencia de P. multocida, proporcionando posibles candidatos para futuros estudios sobre la patogénesis y las interacciones hospedador-patógeno de P. multocida.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La edición del genoma con nucleasas de ingeniería que permiten modificaciones de secuencia dirigidas a un sitio tiene un gran potencial para el fitomejoramiento avanzado y la protección de cultivos. Sorprendentemente, la tecnología de endonucleasas guiadas por ARN (RGEN) basada en las repeticiones palindrómicas cortas agrupadas y regularmente interespaciadas (CRISPR) y la proteína 9 asociada a CRISPR (Cas9) es una herramienta extremadamente potente y sencilla que revoluciona tanto la investigación básica como el fitomejoramiento. Aquí repasamos los principales avances técnicos y las aplicaciones recientes del sistema CRISPR-Cas9 para la manipulación de genomas de plantas modelo y de cultivo. También se discuten las perspectivas futuras de esta tecnología en la mejora molecular de plantas.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Se han determinado las secuencias nucleotídicas completas del genoma mitocondrial (mt) de una especie extremófila Thellungiella parvula (T. parvula) con una longitud de 255.773 pb. El genoma mt de T. parvula es una secuencia circular y contiene 32 genes codificadores de proteínas, 19 genes de ARNt y tres genes de ARN ribosómico con una secuencia de 11,5 oding. La composición de bases de 27,5, 27,5% T, 22,7 , y 22,3% G en orden descendente muestra un ligero sesgo de 55T. Se identificaron 53 repeticiones en el genoma mitocondrial de T. parvula, incluidas 24 repeticiones directas, 28 repeticiones en tándem (TR) y una repetición palindrómica. Además, se han extraído un total de 199 microsatélites perfectos con un alto contenido de A/T (83,1%) mediante el análisis de repeticiones de secuencias simples (SSR) y se distribuyeron de forma desigual en este genoma mitocondrial. También analizamos la evolución de otros genomas mitocondriales de plantas en general, proporcionando pistas para la comprensión de la evolución de los genomas de orgánulos en las plantas. En comparación con otras especies de Brassicaceae, T. parvula está emparentada con Arabidopsis thaliana, cuyos caracteres de resistencia a bajas temperaturas han sido bien documentados. Este estudio proporcionará importantes herramientas genéticas para la investigación de otras especies de Brassicaceae y mejorará el rendimiento de plantas de importancia económica.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

En los últimos años, el microbioma humano se ha convertido en un campo de investigación en auge y cada vez está más claro que el microbioma de los seres humanos desempeña un papel importante para la salud humana. En la actualidad se están llevando a cabo numerosas investigaciones para catalogar y anotar el papel funcional del microbioma humano. Los nuevos métodos de secuenciación permiten explorar y describir el microbioma de cualquier especie. Estas técnicas permiten realizar estudios exhaustivos de la composición del microbioma de organismos no modelo de los que se sabe relativamente poco. Se ha prestado cierta atención al microbioma de especies de insectos, incluidos importantes vectores de patógenos de importancia humana y veterinaria, plagas agrícolas y especies modelo. En conjunto, estos estudios sugieren que el microbioma de los insectos depende en gran medida del medio ambiente, las especies y las poblaciones, y afecta a la aptitud de las especies. Estos efectos pueden tener importantes implicaciones para la conservación y gestión de especies y poblaciones. Además, estos resultados son importantes para nuestra comprensión de la invasión de especies no autóctonas, las respuestas a los patógenos y las respuestas a los productos químicos y el cambio climático global en el presente y el futuro.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La oxidación y la reducción de la metionina (Met) desempeñan un papel importante en la eliminación de las especies reactivas del oxígeno (ROS) y la señalización en los organismos vivos. Para comprender el impacto de la oxidación y reducción de la Met en plantas sometidas a estrés, hemos estudiado los genomas de Arabidopsis y soja (Glycine max L.) en busca de genes que codifiquen proteínas ricas en Met (MRPs). Encontramos 121 y 213 genes que codifican MRPs en Arabidopsis y soja, respectivamente. La anotación de genes indicó que aquellos con función conocida están implicados en procesos celulares vitales como el control transcripcional, la señalización del calcio, la modificación de proteínas y el transporte de metales. A continuación, analizamos los niveles de transcripción de los genes que codifican MRP en condiciones normales y de estrés. Descubrimos que 57 AtMRPs respondían a la sequía o al estrés por alta salinidad en Arabidopsis; 35 GmMRPs respondían a la sequía en la hoja de las etapas vegetativas tardías o reproductivas tempranas de la soja. Entre los genes MRP con una función conocida, la mayoría de los genes sensibles al estrés abiótico están implicados en el control de la transcripción y la señalización del calcio. Finalmente, la planta de Arabidopsis que sobreexpresó un gen que codifica MRP, cuyas transcripciones fueron reguladas a la baja por el estrés abiótico, fue más sensible al paraquat que el control. En conjunto, nuestro informe indica que los MRP participan en varios procesos vitales de las plantas en condiciones normales y de estrés.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La lista de especies amenazadas y en peligro crece rápidamente por diversas causas antropogénicas. Muchas especies amenazadas están presentes en cautividad y se gestionan activamente en programas de cría en los que a menudo se sabe poco de los individuos fundadores. Los recientes avances en las técnicas de investigación genética han hecho posible secuenciar y estudiar genomas completos. En este estudio utilizamos el cerdo verrugoso de Visayan (Sus cebifrons), en peligro crítico de extinción, como caso de estudio para probar el uso de la información genómica como herramienta en la gestión de la conservación. Existen dos poblaciones cautivas de S. cebifrons, originarias de dos islas filipinas diferentes. Encontramos algunas pruebas de una reciente división entre las dos poblaciones isleñas; sin embargo, todos los individuos secuenciados muestran una historia demográfica similar. Las evidencias de endogamia tanto pasada como reciente indican que los fundadores estaban, al menos hasta cierto punto, emparentados. Junto a esto, el bajo nivel de diversidad nucleotídica en comparación con otras especies de Sus supone potencialmente una amenaza para la viabilidad de las poblaciones cautivas. En conclusión, las técnicas genómicas respondieron a algunas preguntas importantes sobre este mamífero en peligro crítico y pueden ser un valioso conjunto de herramientas para informar la futura gestión de la conservación también en otras especies.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

La planta del té (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) se ve afectada por el estrés abiótico durante su crecimiento y desarrollo. Los factores de transcripción (TF) de unión al ADN con un dedo (Dof) desempeñan un papel importante en la tolerancia de las plantas al estrés abiótico. En este estudio, un total de 29 putativo Dof TFs fueron identificados sobre la base de transcriptoma de la planta de té, y los dominios conservados y motivos comunes de estos CsDof TFs fueron predichos y analizados. Las 29 proteínas CsDof se dividieron en 7 grupos (A, B1, B2, C1, C2.1, C2.2, y D2), y las redes de interacción de las proteínas Dof en C. sinensis se establecieron de acuerdo con los datos de Arabidopsis. Se analizó la expresión génica en "Yingshuang" y "Huangjinya" bajo cuatro estreses experimentales mediante qRT-PCR. Los genes CsDof se expresaron de forma diferencial y se relacionaron con las distintas condiciones de estrés abiótico. En total, nuestros resultados podrían sugerir que existe una relación potencial entre los factores CsDof y la resistencia al estrés de la planta del té.

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Por: Hindawi Publishing Corporation | Fecha: 2016

Se analizó un mutante de yema de maduración temprana basándose en el análisis histológico, de SSR y de polimorfismo amplificado sensible a la metilación (MSAP) y se utilizó un enfoque de capas específicas para investigar la diferenciación entre el mutante de yema y su progenitor. Los resultados mostraron que el grosor del tejido esponjoso de la hoja del mutante (MT) es mayor que el del tipo silvestre (WT) y las diferencias son significativas. El tamaño medio de la capa celular L2 aumentó en el mutante y la diferencia es significativa. Los antecedentes genéticos del mutante de la yema revelados por el análisis SSR son altamente uniformes a los de su progenitor; en MT sólo se detectaron las variaciones del marcador SSR VVS2. La proporción de metilación total de MT es inferior a la de WT correspondiente. La proporción de metilación externa en MT es mucho menor que en WT; la proporción de metilación interna media en MT es mayor que en WT. El mutante de yema de maduración temprana presenta cierta proporción de desmetilación en la capa celular L2. Todos los resultados sugieren que la capa celular L2 de la yema mutante de maduración temprana ha cambiado con respecto a la WT. Este estudio proporcionó la base para una mejor comprensión de los rasgos característicos del mutante de yema de maduración temprana en uva.

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